Tag |
Content |
WERAM ID |
WERAM-Thc-0030 |
Ensembl Protein ID |
EOY20940 |
Gene Name |
TCM_012263 |
Ensembl Information |
|
Status |
Unreviewed |
Classification |
Type |
Family |
E-value |
Score |
Start |
End |
HDAC |
Class-II |
1.50e-114 |
383.6 |
180 |
492 |
HDAC |
Class-I |
4.30e-34 |
119.6 |
306 |
486 |
|
Organism |
Theobroma cacao |
Domain Profile |
HDAC Class-II
class-2.txt 2 aglvydekmlkhqaleenkekhpEkpeRiqailsrlqeaglle.kleelkarkatkeelqlvHseehvelletaeklekeelesltvdsdsiylesks 98 +++ +de+ml h+ +e +++ hpE+p+R++ai +l+ ag+ + k+ + ar+ t+eel vHs eh+e++e +++ ++ + ++y++++s EOY20940 180 TAVGFDERMLLHSEVEMKSHPHPERPDRLRAIAASLAVAGIFPgKCYPIPAREITQEELRRVHSLEHIETVELTSQILSSYF------TPDTYANEHS 271 6799***********************************999779**************************99954444433......4589****** PP class-2.txt 99 ikaarlavGavlelvdkvlkgelkngfavvRPPGHHaeestamGFClfnnvavaakllqqklkvkkilivDwDvHhGnGtqeifykdpkvlylSlHRy 196 + aarla+G + +l++++++g+++ngfa+vRPPGHHa ++amGFCl+nn+avaa +q + kk+livDwDvHhGnGtqeif+++++vly+SlHR+ EOY20940 272 AYAARLAAGLCANLASAIFSGRVRNGFALVRPPGHHAGVTQAMGFCLHNNAAVAALAAQAAGA-KKVLIVDWDVHHGNGTQEIFEQNKSVLYISLHRH 368 ******************************************************988777665.********************************** PP class-2.txt 197 dkgsffpesgsgavdevgegkgegfnvNvawngglmgdaeylaafrevvlpiakeFkPdlvlvsaGfDaaegdplgglsvtakcyatltkqllklagg 294 + g+f+p g+ga+ evg++ +eg+ vN++w+ g++gd++y++af++vvlpia++F+Pd+ ++saGfDaa+gdplg ++vt+++ya++t++l+ l+gg EOY20940 369 EGGKFYP--GTGAAFEVGSKGAEGYCVNIPWSRGGVGDNDYIFAFQHVVLPIASKFSPDFTIISAGFDAARGDPLGCCDVTPAGYAQMTHMLSALSGG 464 *******..***************************************************************************************** PP class-2.txt 295 rvvlvlEGGynlkaiaeaveavvkaLlg 322 r++++lEGGynl++i+++++av+k+Llg EOY20940 465 RLLVILEGGYNLRSISSSATAVIKVLLG 492 **************************96 PP
HDAC Class-I
class-1.txt 132 hhakkseasGfcyvnDivlailellk.khkrvlyididlhhGDgveeafyttdrvmtvsfhkyge.effPgtGdlsdvgaekgkyyavnvPl.kdgid 226 hha ++a Gfc n+ +a l + k+vl +d d+hhG+g +e f++ + v+ +s+h+++ +f+PgtG +vg + y+vn+P + g+ EOY20940 306 HHAGVTQAMGFCLHNNAAVAALAAQAaGAKKVLIVDWDVHHGNGTQEIFEQNKSVLYISLHRHEGgKFYPGTGAAFEVGSKGAEGYCVNIPWsRGGVG 403 ****************99999988775899********************************97527************************83568** PP class-1.txt 227 DesyekifksviskvieafePeavvlqcGaDslagDrlgefnlsikghaecvkfvksf.nlpllvlGGGGYtlrnvaRcwtye 308 D+ y f++v+ ++ + f+P+ ++ G D+ gD+lg+ +++ g+a++ +++ llv+ GGY+lr ++ t EOY20940 404 DNDYIFAFQHVVLPIASKFSPDFTIISAGFDAARGDPLGCCDVTPAGYAQMTHMLSALsGGRLLVILEGGYNLRSISSSATAV 486 ********************************************************9977899***********999776655 PP
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Protein Sequence (Fasta) | MVSETVQVSC VTNGGAKNNQ GFKRKHLGSD ENTTACCHDE VSDDKGDIGT SGRDTSTNIN 60 DDTQPDGVSK RKRLPKELTF QDMYNNQDAF DDDDEDDSDW EPVQKHLEIL KWFCTNCTMV 120 NLDDVVHCDI CGEHKESGIL KHGFYASPCS PELDLIQVES EARERDKDLR FEASASNCST 180 AVGFDERMLL HSEVEMKSHP HPERPDRLRA IAASLAVAGI FPGKCYPIPA REITQEELRR 240 VHSLEHIETV ELTSQILSSY FTPDTYANEH SAYAARLAAG LCANLASAIF SGRVRNGFAL 300 VRPPGHHAGV TQAMGFCLHN NAAVAALAAQ AAGAKKVLIV DWDVHHGNGT QEIFEQNKSV 360 LYISLHRHEG GKFYPGTGAA FEVGSKGAEG YCVNIPWSRG GVGDNDYIFA FQHVVLPIAS 420 KFSPDFTIIS AGFDAARGDP LGCCDVTPAG YAQMTHMLSA LSGGRLLVIL EGGYNLRSIS 480 SSATAVIKVL LGESSGYEPE NIVPSKSGLH TVLEVLKIQM KYWPPLSSSY EKLQSQWGMY 540 SMENKKKQVK KRRLFEPPLW WRWGRKQLLY HILTGHFHLK Protein Fasta Sequence
>EOY20940|Class-I|Theobroma cacao MVSETVQVSCVTNGGAKNNQGFKRKHLGSDENTTACCHDEVSDDKGDIGTSGRDTSTNINDDTQPDGVSKRKRLPKELTFQDMYNNQDAFDDDDEDDSDWEPVQKHLEILKWFCTNCTMVNLDDVVHCDICGEHKESGILKHGFYASPCSPELDLIQVESEARERDKDLRFEASASNCSTAVGFDERMLLHSEVEMKSHPHPERPDRLRAIAASLAVAGIFPGKCYPIPAREITQEELRRVHSLEHIETVELTSQILSSYFTPDTYANEHSAYAARLAAGLCANLASAIFSGRVRNGFALVRPPGHHAGVTQAMGFCLHNNAAVAALAAQAAGAKKVLIVDWDVHHGNGTQEIFEQNKSVLYISLHRHEGGKFYPGTGAAFEVGSKGAEGYCVNIPWSRGGVGDNDYIFAFQHVVLPIASKFSPDFTIISAGFDAARGDPLGCCDVTPAGYAQMTHMLSALSGGRLLVILEGGYNLRSISSSATAVIKVLLGESSGYEPENIVPSKSGLHTVLEVLKIQMKYWPPLSSSYEKLQSQWGMYSMENKKKQVKKRRLFEPPLWWRWGRKQLLYHILTGHFHLK
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Nucleotide Sequence (Fasta) | AATATAAAAA TTTAATTAAA CATAATAAGA AAAAAGAATT TATTTAAAAA ATTTTAAATA 60 GTTCAAATTT TTTAAGTATT ATGCAATATA TAGTTGTTGT ATTTTTATTT TGATTTATAT 120 ACTTTTTATG AAATATTAGT AAACTAAAAT AAATTAAAAA TAATGTATTA GATCAAAAAG 180 TTTATAATTT TGAAAATTAA AAAAAATAAA CCATTCATTG AATATCACAG AAAATCAAAT 240 ATAATCTCAA TATATTGAAT ATTATATATA AATATTTTTT TAGATTTTAA ATACATAATA 300 TTTCGCGTCT TTCAAATGAT ACGTGTGATT TCAATTTCCC AAGGGGCAAA CTGGAAAAAA 360 CTTTTGAACA ACCGTGGCCA AAAATAAAAT TACAACAAAA GAAGGGCAAT AACTTAAATC 420 GAGTAAATTA TCAAGGACTT AAATGAAAGA GAAATTCCTC GAAAATCACC AATTGAAAAA 480 TATATAAAAA ATATGTGTTT TAGTTGTCAC CTTCTCTCCT CCCTCAAAAA TTCCGAATTT 540 ACCTCGCGAG ACCCTCCGCG GCTTGCCCTA GCCAGGTAAA AAATGAAAAG AATAAAAGGG 600 TAAATCTTTA TTTTATTTTA ATTTTCATTC TCTTAATTTG TTTTTGCTTT AATTCATATC 660 TTAGTCTTTG TTTTTCTTTC TATTTAACTT TTTTTTAAAA AAAAATAAGC TGCATACATT 720 TATATATTTA TGCATGTTAG GGTTTTCTTC GAGTAATCTC GCCTAGACCC AGACTTCTAG 780 CTTTTATAAA GCATTGGAAT TCCCATTTTA CGTTTTATTT ATTTATTTAT TTATTTATTT 840 ATTTTTTAAA ATTTTGCTTA TGAATTACTA TGTGGGTTTT GACTTTTTAA GTACATATTT 900 CTTCAAAAAA ATTTCTGGGT AGTCTTCGTT TGCTTCACAT TTTAATTTTC TCTATTATTT 960 TAATGGGTAT GTGTAGATGA AATTATTGTT ATGTAGTGTC AGTTTCTTAT TTTCTAATTG 1020 CAGAGTGGTA ATATCAATTT TGACTTAAAT TTTTTTTTTT GGCTTTTGCT TTGCATATTT 1080 CTTTCAAAAA TAAAATGCTT TTTATTTTTT AGTTTATATT TATATATCTA TTTAGCTTAT 1140 GACTTAAATG TAGTTCTTTT TTTTTCTTTT TTTTTTCATA GTTTTAGCTT GCTCACAGTC 1200 TTCATTTTGC TCTTTATGTT AATGGGTATT TGTAGGTTTG ATGTGATTTG CAGCCGTCCC 1260 TTACTTATGC CAGTTTTTAT GTTCTTTAAA AAAATGTAAA ATCTTGATTT AATTGTTGCT 1320 TTTTCTCTGC ATGATATCTT TGAAAAGTAA TGTTTTCATT TCTTTTCTCT ATTGTTCATT 1380 TGTCCAAATA TGGAAAACTA TTATTTTGTT AATTTTTAGA AATAATTATC CTATTTTGAT 1440 TCGTGTTTTG AGGTTTCATG TTTTTGTGCT CTTTTGCTGT CTGATTTATT ATGTATTAAT 1500 TAAGGTTGTG TGGTTTTTTT TTTTTTTTTT TAAATATTAC TGGCAGATGA TTCGGGTTTA 1560 AATGAAGGAA TGATTCTGGC CGGAAGTCTC CATCTAACTC TGAAAACAAT ATGGTTTCTG 1620 AAACAGTTCA AGTGAGTTGT GTGACAAATG GGGGGGCTAA GAACAATCAA GGATTTAAAA 1680 GAAAACATTT GGGATCTGAT GAGAACACCA CAGCTTGTTG TCATGATGAA GTGTCTGATG 1740 ACAAAGGGGA TATAGGAACA TCTGGCCGAG ATACGAGTAC CAATATAAAT GATGACACAC 1800 AGCCTGATGG TGTATCTAAA AGGAAGAGGC TCCCAAAAGA ATTGACTTTT CAGGATATGT 1860 ACAACAATCA AGATGCATTT GATGATGACG ATGAGGATGA CAGTGACTGG GAGCCTGTAC 1920 AAAAGCACTT AGAGATTTTG AAGTGGTTTT GTACCAACTG CACGATGGTC AACCTTGACG 1980 ATGTTGTCCA CTGTGATATA TGTGGGGAAC ATAAGGAATC TGGTATCCTA AAACATGGAT 2040 TTTACGCGTC TCCTTGTTCA CCGGAGTTAG ACCTTATTCA GGTTGAATCA GAAGCCAGAG 2100 AAAGAGACAA AGATTTGCGC TTCGAGGCTT CAGCATCAAA CTGTTCTACA GCAGTTGGTT 2160 TTGATGAGAG AATGTTGCTG CACTCAGAGG TTGAAATGAA GTCGCATCCG CATCCGGAAA 2220 GACCAGATCG TCTCCGAGCT ATTGCTGCAA GCCTAGCTGT TGCTGGTATA TTTCCTGGCA 2280 AGTGCTACCC AATTCCTGCG AGAGAAATCA CTCAGGAGGA ACTTCGAAGG GTCCATTCCT 2340 TGGAACATAT TGAAACTGTT GAACTTACAA GCCAAATTCT TTCCAGTTAT TTTACTCCTG 2400 ACACATATGC TAATGAGCAT TCAGCATATG CTGCTAGACT TGCAGCTGGT TTGTGTGCTA 2460 ATCTTGCTTC AGCAATATTT TCTGGACGTG TGAGAAATGG TTTTGCTTTG GTTCGACCTC 2520 CCGGCCATCA TGCTGGTGTC ACACAAGCAA TGGGATTCTG CCTCCACAAC AATGCAGCAG 2580 TTGCTGCATT AGCGGCTCAG GCTGCAGGGG CAAAGAAGGT GCTCATTGTT GATTGGGATG 2640 TTCATCACGG AAACGGAACC CAAGAGATTT TTGAACAGAA TAAATCGGTG TTGTACATAT 2700 CCTTACATAG ACATGAAGGA GGAAAATTCT ATCCTGGTAC TGGGGCAGCT TTTGAGGTTG 2760 GTTCCAAGGG TGCAGAAGGA TATTGTGTGA ATATTCCATG GAGTCGTGGA GGAGTTGGAG 2820 ATAATGATTA TATTTTTGCA TTTCAACATG TTGTGCTTCC AATAGCTTCC AAGTTTTCTC 2880 CTGATTTTAC CATCATATCA GCAGGATTTG ATGCTGCTCG TGGTGATCCT TTAGGATGCT 2940 GTGATGTGAC TCCTGCTGGT TATGCGCAAA TGACACACAT GTTGAGTGCC CTCTCTGGGG 3000 GAAGGTTGCT AGTTATACTT GAGGGCGGCT ACAACCTCCG TTCAATATCA TCTTCTGCTA 3060 CTGCAGTGAT TAAGGTACTG TTGGGTGAAA GTTCTGGGTA TGAACCGGAG AATATTGTTC 3120 CTTCTAAATC TGGTCTGCAT ACAGTGTTGG AAGTCCTGAA GATTCAGATG AAGTACTGGC 3180 CTCCACTAAG TTCAAGCTAT GAAAAATTGC AGTCACAGTG GGGGATGTAT TCTATGGAGA 3240 ACAAAAAAAA ACAAGTTAAG AAGAGAAGGC TATTTGAGCC ACCCCTGTGG TGGAGGTGGG 3300 GAAGAAAACA GTTATTGTAC CATATCCTTA CAGGGCATTT CCATCTAAAA TGAAAGAGTG 3360 GGTGTTGGAA AATTTTGGGA TTTCATCATC CTCATCCCCT TCTTTATGGT GTAATTTTTG 3420 TTCATCCCAG TCAGGACACA AGATACATTC CGGATAGGTT TTACCCATGT CTGAATTGTT 3480 TTAATGTGAT TGATGATGAT GTGCGCCTCT TTTGACCTGC AGTTTCCTTC AAATATGATC 3540 TTTTGACGAA GTAGCTGTTT GCTGAATCTG TAGGAAGAAA ATAAATAAGA ACACTCAAGT 3600 CTTCCCTCAA AGGATTCAAA TTTTATAAAT ATTTGATTAA ATTTTTGAAT TCGAATATTT 3660 TAGATATTAT CAATTAATAT TTAATTTAAA AAGTTTTAAT TAATTTATAT GTATATTATT 3720 TATACAAATT TTAGGGATAA AATAAAATTA GTTCATAAAA
3761Nucleotide Fasta Sequence
>EOY20940|Class-I|Theobroma cacao AATATAAAAATTTAATTAAACATAATAAGAAAAAAGAATTTATTTAAAAAATTTTAAATAGTTCAAATTTTTTAAGTATTATGCAATATATAGTTGTTGTATTTTTATTTTGATTTATATACTTTTTATGAAATATTAGTAAACTAAAATAAATTAAAAATAATGTATTAGATCAAAAAGTTTATAATTTTGAAAATTAAAAAAAATAAACCATTCATTGAATATCACAGAAAATCAAATATAATCTCAATATATTGAATATTATATATAAATATTTTTTTAGATTTTAAATACATAATATTTCGCGTCTTTCAAATGATACGTGTGATTTCAATTTCCCAAGGGGCAAACTGGAAAAAACTTTTGAACAACCGTGGCCAAAAATAAAATTACAACAAAAGAAGGGCAATAACTTAAATCGAGTAAATTATCAAGGACTTAAATGAAAGAGAAATTCCTCGAAAATCACCAATTGAAAAATATATAAAAAATATGTGTTTTAGTTGTCACCTTCTCTCCTCCCTCAAAAATTCCGAATTTACCTCGCGAGACCCTCCGCGGCTTGCCCTAGCCAGGTAAAAAATGAAAAGAATAAAAGGGTAAATCTTTATTTTATTTTAATTTTCATTCTCTTAATTTGTTTTTGCTTTAATTCATATCTTAGTCTTTGTTTTTCTTTCTATTTAACTTTTTTTTAAAAAAAAATAAGCTGCATACATTTATATATTTATGCATGTTAGGGTTTTCTTCGAGTAATCTCGCCTAGACCCAGACTTCTAGCTTTTATAAAGCATTGGAATTCCCATTTTACGTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTTTTAAAATTTTGCTTATGAATTACTATGTGGGTTTTGACTTTTTAAGTACATATTTCTTCAAAAAAATTTCTGGGTAGTCTTCGTTTGCTTCACATTTTAATTTTCTCTATTATTTTAATGGGTATGTGTAGATGAAATTATTGTTATGTAGTGTCAGTTTCTTATTTTCTAATTGCAGAGTGGTAATATCAATTTTGACTTAAATTTTTTTTTTTGGCTTTTGCTTTGCATATTTCTTTCAAAAATAAAATGCTTTTTATTTTTTAGTTTATATTTATATATCTATTTAGCTTATGACTTAAATGTAGTTCTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTCATAGTTTTAGCTTGCTCACAGTCTTCATTTTGCTCTTTATGTTAATGGGTATTTGTAGGTTTGATGTGATTTGCAGCCGTCCCTTACTTATGCCAGTTTTTATGTTCTTTAAAAAAATGTAAAATCTTGATTTAATTGTTGCTTTTTCTCTGCATGATATCTTTGAAAAGTAATGTTTTCATTTCTTTTCTCTATTGTTCATTTGTCCAAATATGGAAAACTATTATTTTGTTAATTTTTAGAAATAATTATCCTATTTTGATTCGTGTTTTGAGGTTTCATGTTTTTGTGCTCTTTTGCTGTCTGATTTATTATGTATTAATTAAGGTTGTGTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATATTACTGGCAGATGATTCGGGTTTAAATGAAGGAATGATTCTGGCCGGAAGTCTCCATCTAACTCTGAAAACAATATGGTTTCTGAAACAGTTCAAGTGAGTTGTGTGACAAATGGGGGGGCTAAGAACAATCAAGGATTTAAAAGAAAACATTTGGGATCTGATGAGAACACCACAGCTTGTTGTCATGATGAAGTGTCTGATGACAAAGGGGATATAGGAACATCTGGCCGAGATACGAGTACCAATATAAATGATGACACACAGCCTGATGGTGTATCTAAAAGGAAGAGGCTCCCAAAAGAATTGACTTTTCAGGATATGTACAACAATCAAGATGCATTTGATGATGACGATGAGGATGACAGTGACTGGGAGCCTGTACAAAAGCACTTAGAGATTTTGAAGTGGTTTTGTACCAACTGCACGATGGTCAACCTTGACGATGTTGTCCACTGTGATATATGTGGGGAACATAAGGAATCTGGTATCCTAAAACATGGATTTTACGCGTCTCCTTGTTCACCGGAGTTAGACCTTATTCAGGTTGAATCAGAAGCCAGAGAAAGAGACAAAGATTTGCGCTTCGAGGCTTCAGCATCAAACTGTTCTACAGCAGTTGGTTTTGATGAGAGAATGTTGCTGCACTCAGAGGTTGAAATGAAGTCGCATCCGCATCCGGAAAGACCAGATCGTCTCCGAGCTATTGCTGCAAGCCTAGCTGTTGCTGGTATATTTCCTGGCAAGTGCTACCCAATTCCTGCGAGAGAAATCACTCAGGAGGAACTTCGAAGGGTCCATTCCTTGGAACATATTGAAACTGTTGAACTTACAAGCCAAATTCTTTCCAGTTATTTTACTCCTGACACATATGCTAATGAGCATTCAGCATATGCTGCTAGACTTGCAGCTGGTTTGTGTGCTAATCTTGCTTCAGCAATATTTTCTGGACGTGTGAGAAATGGTTTTGCTTTGGTTCGACCTCCCGGCCATCATGCTGGTGTCACACAAGCAATGGGATTCTGCCTCCACAACAATGCAGCAGTTGCTGCATTAGCGGCTCAGGCTGCAGGGGCAAAGAAGGTGCTCATTGTTGATTGGGATGTTCATCACGGAAACGGAACCCAAGAGATTTTTGAACAGAATAAATCGGTGTTGTACATATCCTTACATAGACATGAAGGAGGAAAATTCTATCCTGGTACTGGGGCAGCTTTTGAGGTTGGTTCCAAGGGTGCAGAAGGATATTGTGTGAATATTCCATGGAGTCGTGGAGGAGTTGGAGATAATGATTATATTTTTGCATTTCAACATGTTGTGCTTCCAATAGCTTCCAAGTTTTCTCCTGATTTTACCATCATATCAGCAGGATTTGATGCTGCTCGTGGTGATCCTTTAGGATGCTGTGATGTGACTCCTGCTGGTTATGCGCAAATGACACACATGTTGAGTGCCCTCTCTGGGGGAAGGTTGCTAGTTATACTTGAGGGCGGCTACAACCTCCGTTCAATATCATCTTCTGCTACTGCAGTGATTAAGGTACTGTTGGGTGAAAGTTCTGGGTATGAACCGGAGAATATTGTTCCTTCTAAATCTGGTCTGCATACAGTGTTGGAAGTCCTGAAGATTCAGATGAAGTACTGGCCTCCACTAAGTTCAAGCTATGAAAAATTGCAGTCACAGTGGGGGATGTATTCTATGGAGAACAAAAAAAAACAAGTTAAGAAGAGAAGGCTATTTGAGCCACCCCTGTGGTGGAGGTGGGGAAGAAAACAGTTATTGTACCATATCCTTACAGGGCATTTCCATCTAAAATGAAAGAGTGGGTGTTGGAAAATTTTGGGATTTCATCATCCTCATCCCCTTCTTTATGGTGTAATTTTTGTTCATCCCAGTCAGGACACAAGATACATTCCGGATAGGTTTTACCCATGTCTGAATTGTTTTAATGTGATTGATGATGATGTGCGCCTCTTTTGACCTGCAGTTTCCTTCAAATATGATCTTTTGACGAAGTAGCTGTTTGCTGAATCTGTAGGAAGAAAATAAATAAGAACACTCAAGTCTTCCCTCAAAGGATTCAAATTTTATAAATATTTGATTAAATTTTTGAATTCGAATATTTTAGATATTATCAATTAATATTTAATTTAAAAAGTTTTAATTAATTTATATGTATATTATTTATACAAATTTTAGGGATAAAATAAAATTAGTTCATAAAA
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Sequence Source |
Ensembl |
Orthology |
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Created Date |
25-Jun-2016 |