WERAM Information
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WERAM ID | WERAM-Asm-0230 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein ID | ENSAMXP00000022237.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | kdm4b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Information |
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Status | Unreviewed | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Classification |
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Organism | Astyanax mexicanus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Domain Profile | HDM JHDM3_JMJD2 JHDM3.txt 3 dveeWnlnklktildsvekelkieieGvntpylyvgmlkttfaWhvedmdlysinylhfGapktWyavpseaakrlekllrkefsesak 91 |
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Protein Sequence (Fasta) | MSVENSTEET MDSTSAPDPN SSPPEVPEQV PAPDPTSEVT ELNPQPNPQP PEEPAVEAPL 60 APAPPRDANS AYKIMTFRPT MEEFQDFAKY IAYMETQGAH RAGLAKVIPP KEWKPRQSYE 120 TIEDMVIPAP IMQVVTGQSG LFTQYNIQKK SMTVGEYKKL ANSKKYCTPQ HKDFDDLERK 180 YWKNLTFVSP IYGADISGSL YDQGIPEWNI SHLNTLLDMV EQECGIVIEG VNTPYLYFGM 240 WKTTFAWHTE DMDLYSVNYL HFGQPKSWYA IPPEHGKRLE RLAQGFFPGS SQGCDAFLRH 300 KMTLISPSIL KKYSIPFDRI TQEAGEFMIT FPYGYHAGFN HGFNCAESTN FATLRWVDYG 360 KMATQCSCRK DMVKISMDVF VRCLQPDRYD LWKQGKDTAP LDHLKPTELT SPELEHWRKN 420 RVTFREKMLR RTQQKVKQLR RLKLEELKLL ADEGIELDVA DYQQRVEEKE ALRRQQKEEK 480 MAREALETLE ALEREEQEAA LREEDNEVKK EEGEAKEGDQ EGQNGEKKKK KKKKKKLALP 540 EQGGFQQAFE QFTSSRVADG QNNGNTVTDP GLQSNSFQKM KMAVEVKKSR RHPFSKPPTH 600 TPLFIVKQEA SSDEELYSGL PEGGDVGQEA KKPEEGLLWQ NRSPNFLAEK QFNAAMATIE 660 PHCAVCMLFC PYSQPHKEPP AVAKSLCGTR TRPLVPEMCF SAGAENTEPL PSSARIGEDG 720 TSVLLACTSC NLQVHASCYG VKPDTKQEGW MCSRCSAVAW TAACCLCNLR GGALKMTTDD 780 RWVHVICAIA VAEARFVNSV EREPVDVSAI PDTRKSLKCI YCHKTTKQNC GACIQCSFEN 840 CSTSFHVTCA HLAGVVMKPA DWPYVVSVTC HKHRQTSLKV KSGPRDLSLG QEAIGRSSDG 900 WFYRCTIIGL ASQTYYEVNF DDGSYCDNIF PENVLSHDCL RNGPPELGEF VVVNTVDGRV 960 LNASFVKEHV HKFYQVEFQD ESQLMLKQTE IHSLNQELPK RVMTRLATMN PQDPQAQAPD 1020 GPQAAKRPRL PTPPPPPMTA TESQKDQTPL PVRPPISTYS GLSVTHSNST STSAPPTPMA 1080 TPGAPALQAP QAQTGESFSH SSSYIAYMES LLNSDFPPED RGPEPMY 1127 |
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Nucleotide Sequence (Fasta) | TCCAAACGCG CTCTCCTCTT ACTACGCCTT CGCGCTGACC AATCAGACCG CGCGTTGCTC 60 TGCAGTGGGC GGGACAGCTG ATCCTTCAGC TATGGAACAG TAAAGGAACC AATCTTTTAG 120 GAAGATATTT TAGAAAATAC AGGAGAGAAA AGGCAGAAAC GGCAAGATCG AGATTTATTG 180 AGCACCAGCA GCCGAAGCAG GAGCATTAGC CTACCTGCAG CTATGTCTGT GGAAAACTCC 240 ACAGAAGAGA CAATGGATTC AACTTCAGCT CCAGACCCAA ACTCAAGCCC GCCAGAGGTA 300 CCAGAACAGG TCCCGGCTCC AGATCCGACC TCGGAGGTCA CTGAGCTCAA CCCACAGCCT 360 AACCCACAGC CACCTGAGGA ACCGGCTGTA GAAGCTCCCC TGGCCCCTGC ACCTCCACGA 420 GATGCAAACT CCGCCTACAA GATCATGACT TTCAGACCAA CAATGGAGGA GTTCCAGGAC 480 TTCGCCAAGT ATATTGCATA CATGGAGACC CAGGGAGCTC ACCGCGCTGG ACTCGCCAAG 540 GTGATCCCAC CTAAAGAATG GAAACCCAGG CAATCGTATG AGACGATTGA GGATATGGTA 600 ATTCCAGCCC CCATCATGCA GGTGGTCACT GGCCAGTCTG GTCTTTTCAC TCAATACAAC 660 ATCCAGAAGA AGTCTATGAC TGTTGGAGAA TACAAAAAAC TGGCCAACAG CAAAAAGTAC 720 TGCACTCCTC AGCACAAAGA CTTTGATGAC CTGGAGAGAA AGTACTGGAA GAATCTGACG 780 TTTGTGTCTC CTATCTATGG TGCAGACATC AGTGGATCCC TCTATGATCA GGGCATTCCA 840 GAGTGGAATA TCAGCCATTT GAACACACTC CTGGACATGG TGGAACAGGA GTGCGGCATT 900 GTCATTGAGG GGGTAAATAC ACCCTATCTG TACTTTGGAA TGTGGAAGAC CACCTTCGCC 960 TGGCACACAG AGGATATGGA CCTCTACAGT GTCAACTATC TTCACTTTGG CCAGCCCAAG 1020 TCCTGGTATG CCATTCCTCC CGAACATGGA AAGAGGCTGG AGAGGCTCGC ACAAGGGTTT 1080 TTCCCAGGCA GCTCTCAGGG CTGTGATGCT TTTCTTCGTC ACAAGATGAC TCTCATCTCT 1140 CCCTCCATCC TGAAGAAGTA CAGCATCCCC TTTGATCGGA TCACTCAGGA AGCGGGTGAG 1200 TTCATGATCA CATTCCCGTA CGGGTACCAT GCTGGTTTCA ACCACGGCTT CAACTGCGCA 1260 GAGTCCACCA ACTTCGCCAC ACTGCGCTGG GTCGACTACG GCAAGATGGC CACACAGTGC 1320 TCGTGTCGTA AGGACATGGT GAAGATCTCT ATGGACGTTT TTGTCCGCTG CCTGCAGCCT 1380 GACCGCTATG ACCTGTGGAA GCAGGGCAAG GACACAGCGC CACTGGACCA CCTGAAGCCC 1440 ACTGAACTTA CCAGCCCTGA GCTGGAGCAC TGGAGGAAGA ACCGGGTCAC CTTCAGAGAG 1500 AAGATGCTTC GCAGAACTCA GCAGAAAGTG AAGCAGCTGC GTAGGCTGAA GCTGGAGGAG 1560 CTGAAGCTGC TGGCTGATGA GGGCATTGAG CTGGACGTGG CTGATTATCA GCAGCGTGTG 1620 GAGGAGAAGG AGGCTCTGAG GAGGCAGCAG AAGGAGGAGA AGATGGCCAG GGAGGCACTG 1680 GAGACCTTGG AGGCTCTGGA GAGAGAGGAG CAGGAGGCAG CCCTACGTGA AGAAGACAAC 1740 GAAGTAAAGA AAGAAGAAGG AGAGGCTAAA GAAGGAGACC AGGAAGGACA GAACGGAGAA 1800 AAGAAGAAGA AGAAAAAGAA GAAGAAGAAG CTGGCACTGC CTGAACAGGG CGGCTTCCAG 1860 CAGGCGTTTG AGCAGTTTAC CTCATCCAGG GTTGCAGATG GTCAGAATAA TGGAAACACA 1920 GTCACTGATC CAGGCCTACA GTCCAACTCC TTCCAGAAAA TGAAGATGGC CGTGGAGGTG 1980 AAGAAGAGTC GCAGACATCC TTTCAGCAAG CCACCCACAC ACACCCCACT CTTCATTGTT 2040 AAACAGGAGG CTTCCAGCGA TGAGGAGCTA TACTCAGGGC TGCCAGAGGG GGGCGATGTG 2100 GGGCAGGAGG CCAAGAAACC AGAGGAGGGT CTCCTGTGGC AGAACCGCTC ACCCAACTTC 2160 CTGGCGGAGA AGCAGTTCAA TGCTGCCATG GCGACCATTG AGCCTCACTG TGCCGTCTGT 2220 ATGCTCTTCT GTCCATACTC ACAGCCTCAT AAGGAACCCC CTGCCGTGGC CAAGTCTCTG 2280 TGCGGAACTC GAACCCGGCC GCTGGTTCCT GAGATGTGCT TTAGCGCCGG AGCAGAGAAT 2340 ACAGAGCCTC TGCCCTCCAG TGCCCGCATC GGAGAGGACG GCACCAGTGT CCTGCTGGCC 2400 TGCACCAGCT GCAACCTGCA AGTTCACGCT AGTTGCTATG GCGTCAAGCC AGACACTAAG 2460 CAGGAGGGTT GGATGTGTTC TCGGTGTAGT GCAGTGGCCT GGACAGCGGC 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Sequence Source | Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthology |
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Created Date | 25-Jun-2016 |