WERAM Information
Tag | Content | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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WERAM ID | WERAM-Arl-0028 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein ID | fgenesh1_pg.C_scaffold_8001866 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Information |
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Status | Unreviewed | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Classification |
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Organism | Arabidopsis lyrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Domain Profile | Me_Reader PHD PHD.txt 2 tiClvCgkddegekemvqCdeCddwfHlkCvklplsslpegkswyCpsCk 51 |
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Protein Sequence (Fasta) | MPAPEEEEPI FGWNSTGGRN LRRKKLLVGD KIEVRSLEEG FLGSWYLGTV TSARKRRRRS 60 IRYDNILSDD GTDSLVETVD VSDVVEGLDD CTDVSDTFRG RLRPVPPTLQ FGKSNLAYGL 120 CVDVFFSEAW WEGVLFDHEN GSEKRRVFFP DLGDELDADL QSLRITQDWN EATETWECRG 180 RWLFLDLIEK YKEDNYLPVS VRQLWYDIRD RIGFVRIQEW TCSTRHLWED LMLEVIEDNL 240 RITIHQFLHD YDAEIYPQLK LLNEASKAVY ETNACLSSVL AIAPQEQQFS CIDKDYKPAS 300 QRCQSLSVLT SASGIRSDAS YINKATETSS KKSTAAHKKM ILHKKPGIWH PFDCLAKSGP 360 QAVSSFIRSP LPPMAMRVRM HLKYMGWTIE HMVDEAGRQR FRYLSPNGRL TEHSLRQVCF 420 RLKQRDESLT TPGMANPPSL SCENQTYNTQ EIRCIVLALP ACNRSVALGE GMKPSTDTLL 480 EYETQGNEEV FTRESRNFCP RNAFPGQKKT LHVRLEPKTK AQGIILRLKS KRKQKPKKDE 540 VIVGLQNVNL SMRRGHTSRR LMDIKNRVTG RSKTHVLRSS KRVQRVITPI SRHHSPRSIL 600 SWLIDNNVIL PRENIRYRNQ KDDTVIKEGK LTREGIKCSC CRRIFTISGF EVHANGGSCR 660 AAANIFLDDG RSLLECQVEA YETRKKAQPP DILKMKLRQG ENDVICSVCH YGGKLILCDG 720 CPSAFHANCL GLEEVPDGDW FCESCCCGAC GQFFLKATSK YAKEEKFISC KQCELKYHPS 780 CLRYDGAGDS LDTFLGEKWF CSKDCEEIFV NLCELIGKPR EVGVEKLTWR LVQSFEPNMY 840 GDDAYKIEAV AENHCKLSVA LDVMHELFEP VKRPHGGRDL AEDVIFSRWS KFKRLNFSGF 900 YTVLLERNEE LVTVATVRIL GKKVAEMPFI GTRFQHRQRG MCRVLINELE KVLIDLGVER 960 LVLPAVPCVL NTWINSFGFT KMTISERKEF LKFTLLEFGR TILCQKILIK SSVVDPIPST 1020 VSQGEQHCDI LRIEDNSASD DRSDLHM 1047 |
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Nucleotide Sequence (Fasta) | ATGCCAGCGC CGGAGGAAGA AGAGCCGATA TTCGGCTGGA ACAGCACCGG TGGACGAAAT 60 CTCCGCCGGA AAAAGCTTCT CGTCGGTGAT AAAATAGAGG TAAGGAGTCT TGAGGAAGGG 120 TTTCTGGGTT CTTGGTATTT AGGAACTGTT ACTTCAGCGA GAAAGCGACG TCGGCGTTCT 180 ATCAGATATG ATAACATTCT GTCTGATGAT GGTACTGATT CCCTTGTGGA AACTGTTGAT 240 GTTTCGGATG TAGTAGAAGG GTTGGATGAT TGCACTGATG TTTCTGATAC TTTCCGTGGA 300 CGTTTAAGAC CTGTGCCGCC AACGCTGCAA TTTGGTAAGT CGAACCTTGC GTATGGGCTT 360 TGCGTTGATG TGTTTTTCAG TGAAGCTTGG TGGGAAGGTG TGCTCTTTGA CCACGAAAAT 420 GGTTCTGAGA AAAGGCGGGT GTTTTTCCCT GATTTGGGTG ATGAATTGGA TGCTGATCTT 480 CAATCTTTAC GTATTACTCA GGATTGGAAT GAGGCTACAG AGACGTGGGA GTGTCGTGGG 540 AGATGGTTGT TTCTTGATTT GATTGAGAAA TATAAGGAAG ATAACTATCT CCCGGTTTCG 600 GTAAGGCAAC TTTGGTATGA CATACGGGAC AGGATTGGTT TTGTAAGAAT CCAAGAATGG 660 ACTTGCTCTA CTAGGCATTT ATGGGAAGAT TTGATGCTAG AGGTGATTGA AGATAATCTT 720 AGAATCACCA TTCACCAGTT TCTTCATGAT TATGACGCTG AAATATACCC TCAGTTGAAG 780 CTCTTAAATG AAGCTTCTAA GGCGGTTTAT GAGACCAATG CTTGTCTCAG CAGTGTGCTA 840 GCGATTGCTC CACAAGAACA ACAATTTTCC TGCATTGACA AAGATTATAA ACCGGCAAGC 900 CAGAGATGCC AGTCCTTGTC TGTCTTGACT TCTGCTTCTG GCATAAGGTC AGATGCGAGT 960 TACATCAATA AGGCAACAGA AACTTCCAGC AAAAAATCTA CTGCCGCTCA TAAAAAGATG 1020 ATACTACACA AGAAACCTGG AATCTGGCAT CCTTTCGATT GTCTTGCTAA ATCAGGCCCA 1080 CAAGCTGTGT CGAGCTTTAT CAGGTCACCG TTACCGCCAA TGGCCATGCG TGTCAGGATG 1140 CATCTTAAGT ATATGGGATG GACCATAGAA CATATGGTAG ACGAAGCTGG AAGGCAAAGG 1200 TTTCGCTACC TCTCACCAAA TGGAAGACTA ACAGAGCATT CTCTTCGTCA AGTATGTTTC 1260 AGATTGAAAC AACGTGATGA ATCCCTGACT ACTCCGGGGA TGGCTAACCC TCCTTCTCTG 1320 TCTTGTGAAA ACCAGACGTA TAACACCCAG GAAATAAGGT GTATTGTTTT GGCATTGCCT 1380 GCCTGTAATA GAAGTGTCGC TCTTGGTGAA GGAATGAAGC CGTCTACTGA TACCTTGCTT 1440 GAGTATGAAA CTCAAGGAAA CGAGGAGGTC TTCACGAGGG AAAGCCGCAA TTTCTGTCCC 1500 AGAAATGCCT TCCCGGGTCA GAAAAAGACA CTCCATGTTA GGCTCGAGCC AAAAACAAAA 1560 GCTCAAGGCA TCATCCTAAG GTTGAAAAGT AAGCGTAAAC AGAAACCTAA GAAGGACGAA 1620 GTGATTGTAG GTTTGCAGAA TGTCAATCTG AGCATGAGAA GGGGGCACAC TTCAAGAAGG 1680 TTAATGGATA TTAAGAATCG AGTAACTGGT CGTAGTAAAA CCCATGTGTT AAGATCAAGC 1740 AAAAGAGTGC AACGGGTAAT AACTCCCATC TCAAGACATC ACAGTCCACG TAGTATTCTT 1800 TCCTGGCTCA TTGACAACAA TGTGATTCTA CCAAGGGAAA ATATACGATA CCGTAACCAA 1860 AAGGATGACA CTGTGATAAA AGAGGGGAAA CTAACCCGTG AGGGTATAAA ATGCAGTTGT 1920 TGCCGTAGAA TTTTCACCAT AAGTGGCTTT GAAGTTCATG CTAATGGTGG ATCCTGCAGA 1980 GCAGCAGCCA ATATCTTCCT GGATGATGGA AGATCTCTTT TGGAATGCCA AGTAGAAGCC 2040 TATGAAACAA GAAAGAAAGC ACAACCACCT GATATTCTGA AGATGAAATT GCGTCAAGGG 2100 GAGAACGATG TAATTTGCTC TGTTTGTCAC TATGGCGGTA AACTGATTCT CTGTGATGGA 2160 TGTCCATCTG CCTTCCATGC AAATTGTCTC GGGCTGGAGG AAGTTCCAGA TGGTGACTGG 2220 TTCTGCGAGT CATGTTGTTG TGGTGCATGT GGACAATTCT TTCTCAAGGC TACTAGCAAA 2280 TATGCCAAGG AGGAAAAGTT TATCAGTTGC AAGCAATGCG AACTTAAATA TCACCCTAGT 2340 TGTCTGCGCT ATGATGGTGC CGGTGATTCA TTGGATACAT TCTTGGGAGA AAAGTGGTTT 2400 TGCAGCAAGG ACTGTGAAGA GATATTTGTA AATCTCTGTG AGCTTATTGG AAAACCGAGA 2460 GAGGTGGGCG TGGAGAAATT AACTTGGAGA CTGGTGCAGT CCTTTGAACC AAATATGTAT 2520 GGGGATGACG CTTATAAAAT TGAGGCTGTG GCAGAAAATC ACTGCAAACT CAGTGTTGCC 2580 CTTGATGTGA TGCATGAACT TTTCGAGCCT GTAAAAAGAC CTCATGGTGG AAGAGATCTT 2640 GCTGAAGATG TTATTTTTAG CAGATGGTCA AAATTCAAAC GTTTGAATTT CAGTGGATTT 2700 TACACAGTAC TTCTAGAAAG GAACGAAGAA CTGGTTACTG TGGCTACTGT CAGAATTTTG 2760 GGGAAAAAGG TTGCAGAAAT GCCCTTTATC GGTACTAGAT TCCAGCATCG CCAGCGTGGG 2820 ATGTGCCGGG TTTTGATTAA TGAACTCGAA AAGGTGCTCA TTGACTTGGG AGTTGAGAGG 2880 CTGGTCCTGC CTGCAGTTCC ATGCGTGCTG AACACATGGA TCAACTCATT TGGATTTACA 2940 AAGATGACAA TCTCCGAAAG AAAAGAATTT CTTAAATTTA CCTTGTTGGA ATTCGGACGA 3000 ACAATATTGT GCCAGAAGAT CTTAATCAAG AGCAGCGTGG TAGATCCAAT TCCAAGTACA 3060 GTGTCTCAAG GTGAACAACA CTGTGACATC CTTAGGATTG AAGACAATTC TGCTTCTGAT 3120 GATAGATCAG ATTTACATAT GTAA 3145 |
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Sequence Source | Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthology |
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Created Date | 25-Jun-2016 |