WERAM Information
Tag | Content | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
WERAM ID | WERAM-Thc-0027 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein ID | EOX99098 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | TCM_007714 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Information |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Unreviewed | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Classification |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Theobroma cacao | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Domain Profile | HDM JHDM2 JHDM2.txt 5 rdgklNLasklpknfvrpdlgPklynAyGlateedrklgttnlhldvsdavn 56 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Sequence (Fasta) | MARPRKRLKP ERAPGSCEGV PQSDGEVMGS KENCASAEDQ VEGINGKGQE EEDSEMDGDK 60 AGEVEGKEEG IERKDKKCGD LEGDGEGVAL KKPTKRGRKV KQATVSLKRG TMEIVKEENV 120 EGSSDFVAEK KEEVGEKLKE NGVQPKGEKK LSFVENLEIS NGEDGVSIKE EVDSGADGNG 180 QGNSGAVLKR RLRAVAKKVS YADVQESEDE GFSAKKRSRK GRQKEKVLKS EGQEYGNNEN 240 EDIEIPTKKR GRRGRQKRKV SESEDNEGKD VKEGGKVEQG GDLGADDGKK RSRRGAKNDG 300 KKMDKEVLGN GKSLEKLEES LGMNTKPTYS LRASRVRKAR EESVPYSKKR NFAKWIAEES 360 LMCHQCQRND KGRVVRCKLC KRKRYCIPCL TNWYPKMSED AIADACPVCR DNCTCKACLR 420 MTGLLKKLGK TLKLEFSDDE KVQHSRYLLQ ALLPYIEQFS QEQMKEKVIE SKIQGMLPEQ 480 IQLKQAVCLE DERVYCNNCR TSIVDFHRSC SNCNYDLCLT CCHEIRDGHL QGGQKEVIME 540 YADRGFSYLH GALQCSMSSE VGKSLDSPKE TNSKEHKAAT SRWKANENGS IPCAPKDLDG 600 CGNGLLELRC MFTENAIFEL TEKAEKIAKA LNLGNVLEVS NQQCPCYNSM GEVDTGNGKL 660 RKAAFREDAT DNYLYCPKAK DIQTGDLKHF QRHWANGEPV IVSDVLENIS GLSWEPMVMW 720 RAFRQITHTK HDQQLEVKAI DCLDWSEVMV NIHQFFKGYT DGPFDTKSWP QILKLKDWPP 780 SNEFEKLLPR HHVEFLRCLP FKEYTHSLSG ILNMATKLPE KSLKPDMGPK SYIAYGVAEE 840 LGRGDSVTRL HCDMSDAVRL RHTLVGVATF LTVDVSRLQV QFKHLFFIRC GNLSFMLLCK 900 YTEVGSGCGS VNVLTHTAEV KLTPKELASI DNLKQRHHLQ DQWELFGMGS KVGTNMPGDD 960 SFDISICDKQ SSDRSGDQEG DVIVQQDCQD GYSSLNSNNM GREFEMEKSG KAKVDQEKCM 1020 ENGRLYETSR NKIEEVEAVE GGAIWDIFRR QDVPKLQDYL KKHFGEFRYV HCCPVSQVFH 1080 PIHDQTFFLT LDHKAKLKKE YGIEPWTFVQ KLGEAVFIPA GCPHQVRNIK SCIKVALDFV 1140 SPENVGECVR LTEEFRVLPQ DHRAREDKLE VKKMTVHAIC EAVNYLDPNA KIELANKVE 1199 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Nucleotide Sequence (Fasta) | CGAAATTTTA TTTAGTTGAG CGTAAGTTAC AATCTCGCAG TCGGAATCCG GGACACACTT 60 GGACAACTTC CGGATTCTTC GATTCTTATT GCATCGAAGT GCGAGAACTC CAAACTTTTT 120 TAATGTCTGT CTGGTCTGGA CTGAAGTGGG CAGTTCCAAT TTCCAGCTCA TGGGTTTCCA 180 TTTTCTCCAA CACTGCGCCG TCCTACTTTG CAATCACTTC ATTTCAAATC AAACTTCATC 240 AAAATCAACG GGCGAATTTT GCTTTCCCTC CCAAATTTTG ATTTTTCATG TTTTTAACCC 300 ACACTTAAAG CAAAAAAAAC GCCCTAACCC TAATTCTACC GTACATATTT ATTTTGAAAC 360 TTTCTATTAT TGGCGGTTGG CGCCAGTTTG CCGAGCTCTA CAGTACTCAA TCTTCTTTTA 420 TTACTAAAAC ATCTTACTTC ATTTAGAAAC TCACATAAAA AGAAAAAAAA AAAGAGAATG 480 TTCTTCGTTC TCTCTCTCTC TCTTTCTGAA AGACTCTAAT TGGTGATTGA GGCTTAATCT 540 TCGTCTTATA ACTTTAAAGA TCATTTTGTT TGTGGATGGC ACGCCCGAGG AAGAGGCTGA 600 AGCCGGAGCG AGCCCCCGGC AGCTGCGAAG GAGTGCCGCA AAGCGATGGT GAAGTTATGG 660 GAAGTAAAGA AAATTGCGCT TCTGCGGAGG ACCAAGTTGA AGGGATAAAT GGGAAGGGAC 720 AAGAGGAGGA AGACAGTGAA ATGGATGGGG ACAAAGCAGG GGAAGTAGAA GGAAAAGAGG 780 AGGGGATTGA AAGGAAGGAT AAGAAATGTG GGGATTTAGA AGGGGATGGG GAAGGGGTTG 840 CTTTAAAGAA GCCTACCAAA AGAGGTAGAA AGGTAAAGCA AGCGACTGTT TCTTTGAAAA 900 GGGGCACAAT GGAGATTGTG AAAGAGGAAA ATGTTGAGGG AAGTTCGGAT TTTGTGGCTG 960 AAAAAAAGGA AGAAGTTGGA GAGAAATTGA AGGAAAATGG TGTTCAACCG AAAGGTGAGA 1020 AAAAGCTGAG TTTTGTTGAG AATCTAGAGA TATCAAATGG AGAAGATGGA GTTAGTATCA 1080 AAGAGGAAGT TGATTCGGGT GCTGATGGTA ATGGGCAAGG AAATAGTGGG GCTGTTTTGA 1140 AGAGGAGATT GAGAGCAGTT GCTAAGAAGG TTAGTTATGC CGATGTTCAA GAATCTGAAG 1200 ATGAAGGGTT TTCGGCAAAG AAGCGTAGTC GAAAGGGTAG GCAGAAGGAG AAGGTTCTTA 1260 AATCTGAAGG TCAAGAATAT GGTAATAATG AGAACGAAGA TATTGAAATA CCTACAAAGA 1320 AGAGAGGAAG AAGGGGTAGG CAAAAGAGAA AAGTTTCCGA AAGTGAAGAC AATGAAGGGA 1380 AAGATGTAAA GGAGGGGGGT AAAGTAGAGC AAGGCGGTGA TTTAGGTGCA GATGATGGAA 1440 AGAAGAGGAG TCGAAGAGGG GCAAAGAACG ATGGAAAGAA GATGGATAAA GAAGTTTTAG 1500 GAAATGGGAA AAGTCTGGAA AAACTAGAGG AATCTTTGGG AATGAACACT AAACCAACAT 1560 ATTCGCTTAG GGCCTCGAGA GTTCGCAAGG CAAGAGAGGA GTCTGTGCCA TATTCAAAGA 1620 AGCGAAACTT TGCTAAGTGG ATTGCAGAAG AATCATTAAT GTGCCATCAG TGCCAGAGGA 1680 ATGATAAAGG CCGGGTTGTG AGGTGCAAAC TTTGCAAGCG GAAACGATAT TGCATCCCCT 1740 GCTTAACAAA TTGGTATCCC AAGATGTCAG AGGATGCTAT TGCTGATGCC TGCCCAGTTT 1800 GTCGGGATAA TTGCACTTGC AAGGCATGCT TGCGCATGAC TGGACTTCTC AAAAAATTGG 1860 GAAAGACACT AAAGTTGGAG TTCAGTGATG ATGAAAAGGT TCAGCACTCT AGATACTTAC 1920 TTCAGGCACT TCTTCCGTAC ATTGAACAAT TTAGTCAAGA GCAAATGAAA GAGAAGGTCA 1980 TTGAGTCAAA AATTCAAGGG ATGCTCCCCG AACAAATACA GCTTAAGCAG GCAGTTTGTC 2040 TTGAAGATGA GCGTGTATAT TGTAACAACT GCAGAACTTC AATTGTCGAC TTTCATAGAA 2100 GTTGTTCTAA TTGTAACTAT GATCTCTGCC TTACGTGTTG CCATGAAATC CGCGATGGAC 2160 ATTTGCAGGG TGGACAAAAG GAAGTAATTA TGGAATATGC TGATAGGGGT TTTTCTTACT 2220 TGCATGGAGC GCTTCAGTGC TCTATGTCTT CAGAAGTTGG GAAGTCTTTG GATTCCCCCA 2280 AGGAAACTAA TTCTAAAGAA CATAAAGCTG CAACTTCTAG GTGGAAGGCA AATGAAAATG 2340 GTAGCATTCC TTGTGCCCCG AAGGATTTGG ATGGGTGTGG TAATGGCCTT TTGGAGTTAA 2400 GGTGTATGTT TACAGAAAAT GCTATTTTTG AGTTAACAGA AAAGGCTGAG AAAATAGCCA 2460 AAGCTCTCAA TCTTGGGAAT GTTCTTGAAG TTTCTAACCA ACAGTGCCCT TGTTACAATT 2520 CAATGGGAGA AGTTGACACT GGCAATGGTA AGTTAAGGAA AGCAGCTTTT CGTGAAGATG 2580 CCACTGACAA TTATTTATAT TGTCCAAAAG CTAAAGATAT TCAGACTGGT GATTTGAAAC 2640 ATTTCCAAAG GCATTGGGCT AATGGTGAGC CTGTTATTGT CAGTGATGTA CTTGAGAATA 2700 TATCTGGTTT GAGTTGGGAG CCAATGGTTA TGTGGCGTGC TTTTCGTCAG ATTACACATA 2760 CTAAACATGA CCAACAGTTG GAAGTTAAGG CCATTGATTG CTTAGATTGG TCTGAGGTGA 2820 TGGTCAATAT TCACCAATTC TTTAAGGGGT ATACAGATGG TCCATTTGAT ACAAAATCAT 2880 GGCCGCAGAT ACTGAAGCTG AAAGATTGGC CTCCCTCTAA TGAATTTGAG AAGCTCCTTC 2940 CACGTCATCA TGTGGAGTTT CTTCGTTGTT TGCCTTTTAA AGAATATACC CATTCTCTAA 3000 GTGGCATTCT TAATATGGCT ACCAAATTAC CAGAGAAATC TCTAAAGCCA GATATGGGGC 3060 CAAAGTCATA TATTGCTTAT GGAGTTGCTG AAGAGCTTGG GCGTGGAGAC TCTGTAACCA 3120 GGCTTCATTG TGATATGTCC GATGCGGTGA GGCTGAGGCA CACCCTAGTT GGTGTAGCCA 3180 CATTCTTGAC AGTTGATGTT TCAAGACTTC AGGTGCAATT TAAGCATCTT TTCTTCATTA 3240 GATGTGGAAA CCTGAGCTTT ATGTTGCTGT GCAAGTACAC TGAAGTTGGT AGTGGCTGTG 3300 GTTCTGTGAA TGTTTTGACA CACACAGCTG AGGTGAAGCT TACACCTAAA GAGCTTGCTA 3360 GCATTGACAA TTTAAAACAA AGGCACCATC TGCAAGACCA GTGGGAACTT TTTGGAATGG 3420 GTTCGAAGGT GGGCACGAAT ATGCCTGGTG ATGATTCTTT TGACATCTCC ATTTGCGACA 3480 AGCAGTCTAG TGACAGAAGT GGTGATCAAG AAGGTGATGT TATTGTCCAA CAAGATTGTC 3540 AAGATGGTTA TTCTAGCCTG AATAGCAATA ATATGGGGAG AGAATTTGAA ATGGAAAAGA 3600 GTGGGAAGGC AAAAGTGGAT CAGGAAAAAT GCATGGAGAA TGGCAGATTG TATGAAACTT 3660 CTAGGAATAA GATTGAAGAA GTGGAAGCTG TTGAGGGAGG TGCTATCTGG GACATTTTCC 3720 GGAGGCAAGA TGTTCCCAAG CTGCAGGATT ACCTTAAAAA GCATTTCGGG GAGTTTAGAT 3780 ATGTTCATTG TTGCCCAGTA TCACAGGTTT TTCATCCAAT ACATGATCAG ACCTTTTTTC 3840 TGACTCTGGA TCATAAGGCA AAGCTTAAGA AGGAATATGG AATTGAACCG TGGACTTTTG 3900 TTCAGAAACT TGGGGAGGCT GTTTTTATAC CTGCAGGTTG TCCTCATCAA GTCCGGAACA 3960 TTAAGTCATG CATAAAGGTT GCACTTGATT TTGTTTCACC TGAAAATGTT GGTGAGTGTG 4020 TTCGCTTGAC AGAAGAATTT CGTGTACTTC CTCAAGATCA TAGGGCAAGA GAGGATAAAT 4080 TGGAGGTGAA GAAAATGACT GTTCATGCAA TCTGTGAGGC TGTGAATTAC TTGGATCCAA 4140 ATGCAAAGAT TGAGCTTGCT AATAAAGTTG AATGAGTTGC AACTTTGTTC CTGCTTCTTA 4200 GCTGGAGGTT ACACTTGCAA AGTGGGCACA TCTTTTGGAG TTCCATTTCT CAGAACATGA 4260 CTTTGTTTAT CTGCAGCATC TAGTAAGAGG TAGGACATGG CTTATAACCA AAAAGAAGAT 4320 GTAGAACATG GGAACTATCT TCCTGTTTCT GTGTATATAC CCCTAAATCT GGCTTGCTTT 4380 TTGGGCTCTC AGCTAGAGCC TGGTAATGTA TGTAGGTTCA AGTGCTATTG ATAAGTGTTA 4440 CAGGCAAGCA CATGCTGTTT TTGTAGCTAC TGATGTTTCC ACCACGTATT TATATTAAGA 4500 GTACTGGCTT TAGCTCACTA AAGTTAGGTC TACCAAAAAT GACAACTATT GTGCTCTTCA 4560 AATCCATATT ATATCTTTTT CAGAGTTATT ATATATAAGT TGAACTTATG GCAATAAATA 4620 TTTTGTGAGA AT 4633 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence Source | Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthology |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Created Date | 25-Jun-2016 |