WERAM Information
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WERAM ID | WERAM-Cae-0033 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein ID | C26C6.1a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | pbrm-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Information |
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Status | Unreviewed | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Classification |
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Organism | Caenorhabditis elegans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Domain Profile | Ac_Reader Bromodomain BROMO.txt 8 pF.repvdpqleipdYydiikePmdLstikerleegnYsspeefvkDvrlifnNakaynenkss 70 |
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Protein Sequence (Fasta) | MSTKRKRAAE PDPEKDVAST STASKKRKGR MTIAEKEKRE FEMAKGNYVM AQIRKHRSSA 60 GNNSVFESFL RLPPRRFEPE YYEQVKEPID VTTIQHKLKI PEYLTYDQFN DDFMMFIKNN 120 LTYYKDESEE HKDMMKIQEL FEAATAKVKS GEYLDDAEDE EGDEDVEETV QEEEEPEESG 180 TSSRDSTPMD LDHFMLCDLL GAVLEATDNT GRLLCPPFRV LQSREDFPLY YEKIAKPIDL 240 KTIAQNGVNK KYSTMKELKD DLFLLFKNAQ QFSGNGSDIF KDAEQLKTVV KEKIARLEEK 300 GVHPMRRAKA TRLVDALLTA VAVNENFSED SEEDEETETN SEPMWKLYWT IRNAVHEKDR 360 NVTLADNFLE LPSKESYPDY YDEIKNPVSI FMINKRLKNG KYDLKSLVAD LMQMYSNAFD 420 YNLESSEVYI SAEKLKALTI STCKQLVPSF DVSQYEPAPA QLTPVKPKAT PHRARIKIEM 480 PDTDSEDSRT PPPTHKRKSP KKPRENGSVP TPTFKGRKST IPVDPNAAYM KQKAMMQGLW 540 NVIHSYRVAS NPGHWPAGAF IQLPSAKQYP EYYQIIQNPI DMKTIRMRID GHQYPQVDAM 600 INDCRVMFSN ARDFNEPRSM IHMDAIQLEK AVLRAYEGMR NTSLGSSIPS TPHSSSSNLM 660 KAMKLKTPKS EVRGRGKKNF SGSDDEESAR INIQQHQRSM EDAIMQLPIE EQKMWRLFKS 720 MKDVREEGTN RPLAVNFMRL PSKEEFPAYY DVIKKPMDMM RIKHKLENRQ YVTLLDVVSD 780 FMLMLSNACK FNETDSDIYK EAVSLQKALL EMKRELDTGD DAPRVQVELR TIFTSIFASL 840 FSKKDEEGKC YSDHLTEFTE VLKANGVPSS EWPFTLDQIK MNIDKCRYRR LDKLQKDFFD 900 LFERARELSK AGSSMYEAAC TLQKSFIVER DTRCKDLIHS NAYCVIEKDI DEAIEKERSL 960 KAKEEHDEEG GNKPAMVKRH ESEVEMEDIE IDGTKYVAPC YAYVSRSDEK KTPLHIFRIE 1020 RTFKDENGEK ALQGHWVYRP EETLHLASRK FMKQEVFLTP FRDTVLAERL RGRCVVISLS 1080 TYTSKVITEY SEEDVYLCEY KYHGKPKYFA KLRTWPFTAE DEELEYTKRT KLMTPKRNLT 1140 AVDSDGNEGK DDVIVDGEEE EDEEDRARLE VSLDMERFEL EASKDEESGK TYFQQIRSET 1200 GKFFWLGQCV LVFNNMKPLC DVMKINKIWR EKDGSEWFSG CWFARPSETI HDEGRLFFKN 1260 EVIAVYRNDE TRKLCEIQRV CDVMPAKLYI KQRQTEVSEC DVFVCETMVN GSADTPDDCS 1320 LFGFQSIVDE FSDAQTMNLD YGKAMRKMKA HKLHVSIPNE EVLFYKQPIK MDKELSPLLK 1380 GEGVMPLDHL DEMMDDDTDG SESVSSSIHP KILKEGSPPA TVQSQTSSVS TPPQHPSISA 1440 EMPIMTPKAV KSKSGYILFS AEVRKRIMHE NPDAGFGEVS KIVGIEWKKL SEEQKKHYEM 1500 RAEVVAVEKA KQDAIKASQA MTLLPGQVRI YQCKWAACDS QYDTESALLE HVIQHHTSQI 1560 IMDSDQQFVC MWMTCLRNRK DGKPFPSLPR LHRHIKEKHM PTAAKNIYSN QLGKNFFKSI 1620 PNQGDTPGCR IVSAPYGQLP TAPSNGGIPP QQQHQQQQHH GNGMNGNMQQ GAPQVINRHP 1680 VSQQMHHQHP QHMQQHHDHH PHQQHYQQGG QPHPQMQMGP PQNGMFQQGS SSSQQYHQAP 1740 PQQMIQQQHQ QPGPPPQQQQ PQMQPIVVTD VGRTVVRAVV PAFVAPPNQI HSRRVLHSEA 1800 YLKYIESLAQ NRQKSVSRWE RTLGATARNT QPAGNARAPS HWIRRIENGR PVAREEDVTK 1860 ALWKLRDELL KSTCSLVMDR PTQ 1883 |
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Nucleotide Sequence (Fasta) | ACTCAATGAG TACGAAAAGA AAGCGTGCTG CCGAGCCCGA CCCGGAAAAG GATGTTGCTT 60 CCACTTCTAC CGCTTCCAAG AAGCGGAAAG GACGAATGAC AATTGCGGAA AAGGAAAAGC 120 GAGAGTTTGA GATGGCGAAG GGTAATTATG TGATGGCACA GATTCGAAAA CATCGAAGTT 180 CCGCCGGCAA TAATTCTGTA TTCGAGAGTT TTCTCCGATT ACCGCCACGC CGCTTCGAGC 240 CTGAATATTA TGAGCAAGTA AAAGAGCCGA TTGATGTTAC CACAATCCAA CATAAACTGA 300 AAATTCCCGA ATATTTGACG TATGATCAGT TTAATGATGA TTTCATGATG TTCATTAAAA 360 ACAACCTCAC TTACTACAAA GACGAATCTG AAGAACACAA GGATATGATG AAAATTCAAG 420 AACTTTTCGA GGCTGCTACC GCTAAGGTGA AATCTGGAGA ATATCTAGAT GACGCAGAGG 480 ACGAAGAGGG AGACGAAGAT GTGGAAGAGA CAGTTCAGGA AGAGGAAGAA CCTGAAGAGA 540 GTGGAACATC ATCTCGTGAT TCGACACCTA TGGACCTGGA TCACTTCATG CTTTGTGATC 600 TTTTGGGAGC GGTTCTTGAA GCGACTGATA ACACCGGAAG GCTTCTTTGC CCACCATTCC 660 GAGTTCTTCA AAGTCGAGAA GATTTCCCAT TGTACTATGA GAAAATAGCT AAACCAATTG 720 ATCTCAAAAC GATTGCTCAA AACGGAGTGA ACAAGAAGTA TTCCACAATG AAAGAACTCA 780 AAGATGATCT ATTCCTGCTC TTCAAAAATG CACAGCAGTT TAGTGGAAAC GGTAGTGATA 840 TTTTCAAAGA TGCTGAACAA TTGAAAACTG TTGTGAAAGA AAAGATTGCT CGATTGGAAG 900 AGAAGGGAGT TCATCCAATG AGAAGAGCCA AAGCCACACG ACTCGTTGAT GCTTTGTTAA 960 CCGCTGTTGC AGTTAATGAA AACTTCTCAG AAGATTCAGA AGAGGACGAA GAAACTGAAA 1020 CAAATTCGGA GCCTATGTGG AAGTTGTATT GGACAATCAG AAATGCTGTT CACGAGAAAG 1080 ATCGAAATGT TACGCTGGCT GACAACTTTT TGGAACTTCC AAGCAAAGAA TCTTACCCCG 1140 ACTACTATGA TGAGATCAAA AACCCTGTGT CAATTTTCAT GATAAATAAA AGATTGAAAA 1200 ATGGGAAATA TGATTTGAAA TCTCTCGTCG CTGATCTCAT GCAAATGTAT TCAAATGCTT 1260 TCGACTACAA TCTTGAATCA TCAGAAGTCT ACATTTCTGC GGAAAAGCTG AAGGCACTAA 1320 CGATATCCAC GTGCAAGCAA CTTGTTCCTT CATTCGATGT TTCTCAATAC GAACCTGCTC 1380 CGGCACAACT TACACCAGTG AAACCAAAAG CGACACCACA CAGAGCTCGA ATTAAGATTG 1440 AGATGCCGGA CACAGACTCG GAAGATAGTA GGACTCCACC TCCTACTCAT AAAAGGAAAT 1500 CTCCGAAAAA ACCTCGTGAA AATGGAAGTG TTCCTACTCC AACTTTTAAA GGCAGAAAAT 1560 CGACGATCCC TGTCGATCCA AATGCTGCTT ATATGAAGCA AAAAGCAATG ATGCAAGGGC 1620 TTTGGAACGT TATCCATTCC TACAGAGTCG CTTCGAATCC GGGACATTGG CCAGCGGGAG 1680 CATTCATACA ATTGCCATCT GCCAAACAAT ATCCAGAATA CTATCAAATT ATTCAAAATC 1740 CGATTGATAT GAAAACGATT CGGATGAGAA TAGATGGACA TCAGTATCCA CAGGTTGATG 1800 CAATGATCAA CGATTGTCGA GTGATGTTTT CGAATGCTAG AGATTTCAAT GAACCCCGTT 1860 CAATGATACA CATGGATGCT ATTCAACTAG AGAAAGCAGT TTTGCGAGCT TATGAAGGAA 1920 TGAGAAACAC GTCACTGGGC TCTTCAATAC CGTCAACTCC TCATTCGTCA TCGTCAAATC 1980 TTATGAAAGC AATGAAACTA AAAACTCCGA AATCCGAGGT CCGTGGTCGC GGTAAAAAGA 2040 ACTTTAGTGG ATCTGATGAT GAGGAATCAG CTCGAATTAA CATACAACAA CATCAAAGAA 2100 GCATGGAGGA TGCTATAATG CAGCTTCCAA TCGAAGAGCA AAAAATGTGG AGATTGTTCA 2160 AATCTATGAA AGATGTTCGT GAGGAAGGAA CCAACCGTCC ATTGGCTGTA AACTTCATGC 2220 GTCTTCCATC AAAGGAGGAA TTTCCTGCAT ATTATGACGT CATTAAAAAG CCGATGGATA 2280 TGATGAGGAT CAAGCATAAG CTGGAGAATC GTCAGTATGT AACACTGCTT GATGTGGTTT 2340 CTGATTTCAT GCTAATGCTT TCTAATGCCT GCAAATTCAA TGAGACTGAT TCTGACATCT 2400 ACAAGGAAGC AGTTTCTCTT CAGAAGGCAC TTTTGGAAAT GAAGCGAGAG CTTGATACCG 2460 GAGATGATGC ACCAAGAGTT CAGGTTGAAT TGAGAACCAT ATTTACTTCA 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CGTTTCTTGA 5880 TTGTATTTCT TACTACCCAC TTCAGTCACT AAATTTATTA TCATTTCCAA TTCACCTTTT 5940 TTTAAAATAT TTTTATTAAT GGGTCGGGTA TGAAACAAAT TCAAACGATA AATCAAACAT 6000 CA 6003 |
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Sequence Source | Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthology |
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Created Date | 25-Jun-2016 |