WERAM Information
Tag | Content | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
WERAM ID | WERAM-Art-0056 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein ID | AT2G42150.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Uniprot Accession | O48523; O48523_ARATH | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Protein ID | NP_181745.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | DNA-binding bromodomain-containing protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Nucleotide ID | NM_129778.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | At2g42150;BRD9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Information |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Details |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Reviewed | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Classification |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Arabidopsis thaliana | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NCBI Taxa ID | 3702 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Functional Description (View) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Domain Profile | Ac_Reader Bromodomain BROMO.txt 3 hevsepFrepvdpqleipdYydiikePmdLstikerleegnYss.peefvkDvrlifnNakaynenkss 70 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Sequence (Fasta) | MAKPENDVTL TEKQTWSTWE ELLLACAVHR HGTESWNSVS AEIQKLSPNL CSLTASACRH 60 KYFDLKSRFT QELPVPESVA EISTAPWLEE LRKLRVDELR REVEQYDLSI STLQSKVKQL 120 EEEREMSFIK PDTETENLDL ERKKERSDSG EPVPNPPVQL MNETISPDPK EIGSENTERE 180 EEMAGSGGGE SKLAGEDSCR GSCESVEKEP TTNSERVEPV SVTELIESED GASRGEEITS 240 DVQSSASLPR KGTSEPDKED QSPTSAKDFT VESQPLISFV EILLSHPCGS HFSRRLERQE 300 TIEYGTIIRE HVDFEIIRKR VEGGLYKSWR INFFRDLLLL VNNARVFYHR GSSEFKFAEQ 360 LHQLVKKQMT TTLKGLSNRD EISISPPKEE VVAIPSSKPV SSKPRMSVPN IVACRKRSAL 420 AAKPLLLLPP GPDKKAKKTD HVVDYDEKPV SDKDGEASGK DDDDSLIVKI MTRGRTSSTG 480 KVANRNDKNR DSSLNVDDSK DKVKKTDEEK KGGSKKKRAA SFLRRMKVGS SDDTLKRSSA 540 ADSSTTGKGG GAEQRKNNSN KADNKKTPIP KIRQTNKKAS PVKRSNNGRN SEREAAPSSS 600 SYPILAKRSR DAGEKEEASS YSPRLKKRAR R 631 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Nucleotide Sequence (Fasta) | AAAAATATAA CGAAGGGAAA GACTAAAGAA GAGACACATT CATTAACAAT TCATACACCT 60 TTGTTCAAAT CAACGAATAA GCTTCTTTAT TTTAATGGCA AAGCCGGAAA ATGACGTCAC 120 CTTAACCGAG AAACAAACAT GGAGCACATG GGAAGAGCTT CTTCTCGCCT GCGCCGTACA 180 CCGTCACGGT ACCGAATCAT GGAACTCTGT TTCCGCCGAA ATCCAGAAAC TGAGTCCCAA 240 CCTCTGTTCC CTCACCGCCT CCGCTTGCCG CCACAAGTAC TTCGACCTCA AAAGCCGGTT 300 CACCCAAGAG CTGCCCGTAC CGGAATCCGT CGCTGAGATC TCAACCGCTC CTTGGCTAGA 360 GGAGTTAAGG AAGCTCCGCG TCGATGAGCT CCGTCGCGAA GTTGAACAGT ACGATTTATC 420 TATCTCCACG TTGCAGTCGA AGGTGAAGCA ATTGGAAGAA GAGAGAGAGA TGAGTTTCAT 480 TAAACCGGAC ACGGAAACCG AGAATTTAGA TCTAGAGAGG AAGAAAGAGC GTAGCGATTC 540 CGGTGAACCA GTCCCAAACC CGCCGGTTCA GCTAATGAAC GAAACCATTT CTCCAGATCC 600 CAAAGAAATC GGATCGGAAA ACACGGAGAG GGAGGAGGAA ATGGCCGGAA GCGGCGGCGG 660 AGAATCGAAG CTTGCCGGAG AGGATTCTTG TAGAGGAAGC TGTGAAAGTG TGGAGAAGGA 720 ACCGACGACG AACTCGGAGA GAGTTGAACC GGTGAGTGTG ACCGAGTTGA TAGAGTCGGA 780 GGACGGAGCG AGTCGTGGAG AGGAGATTAC TAGTGATGTG CAGAGCTCGG CGAGCTTGCC 840 AAGAAAGGGA ACGTCGGAGC CGGATAAGGA AGATCAATCT CCGACGAGCG CCAAAGATTT 900 CACCGTTGAA TCACAGCCGT TGATTAGTTT TGTCGAGATT CTTCTGTCTC ATCCCTGTGG 960 TTCCCACTTT TCGCGCCGAC TCGAACGTCA GGAAACAATT GAGTACGGTA CAATAATTAG 1020 AGAGCACGTA GATTTTGAGA TAATTCGGAA GCGAGTCGAA GGAGGCTTGT ACAAAAGTTG 1080 GAGGATCAAC TTCTTTCGTG ATTTGCTGCT ACTTGTTAAT AATGCAAGAG TGTTTTATCA 1140 CAGAGGATCT TCAGAGTTTA AATTTGCTGA GCAGCTTCAC CAACTCGTCA AGAAACAGAT 1200 GACTACTACT CTCAAGGGAC TTAGTAATAG AGATGAGATC TCAATCTCAC CACCAAAAGA 1260 AGAAGTTGTT GCAATCCCTT CATCAAAGCC TGTTTCTTCT AAACCAAGAA TGTCTGTTCC 1320 TAATATTGTA GCTTGTCGGA AACGTAGTGC CTTGGCTGCT AAACCTTTGC TATTATTGCC 1380 TCCTGGACCA GATAAAAAGG CCAAGAAAAC AGATCATGTT GTGGACTATG ATGAGAAGCC 1440 GGTTTCAGAC AAGGATGGTG AAGCCTCTGG GAAAGACGAT GATGACTCTC TGATTGTGAA 1500 GATAATGACT AGAGGAAGAA CCTCCTCGAC GGGAAAAGTA GCTAACAGGA ACGACAAGAA 1560 CCGTGACTCC AGTTTGAATG TTGATGATAG CAAAGATAAG GTTAAGAAAA CTGATGAAGA 1620 GAAGAAAGGT GGCTCGAAAA AGAAAAGGGC TGCGAGTTTT CTCAGGAGAA TGAAAGTGGG 1680 CTCTTCGGAT GACACATTGA AGCGTAGCTC TGCTGCTGAT TCTTCTACTA CGGGAAAAGG 1740 AGGAGGAGCG GAACAGAGGA AGAATAACAG CAACAAAGCT GATAATAAGA AAACACCGAT 1800 ACCAAAGATA AGACAAACAA ATAAGAAAGC AAGTCCTGTG AAGAGAAGCA ATAATGGTCG 1860 AAACTCAGAA AGAGAAGCTG CTCCATCTTC TTCATCTTAT CCTATTCTAG CAAAGCGAAG 1920 CAGAGATGCT GGTGAAAAAG AGGAGGCGTC TTCTTATTCA CCACGCTTGA AGAAACGTGC 1980 AAGGAGGTGA TTTAGTTATT GTACTACTTC TATAACTTAA CTTGAGATGA AAATCAGAAA 2040 CTAATAAATT CCAAAGAGTC GCAAAACATT CGAAAGGATA TGCTTATAGA TATATTTGGG 2100 CCCAC 2106 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence Source | Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Keyword | KW-0175--Coiled coil |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interpro | IPR001487--Bromodomain |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PROSITE | PS50014--BROMODOMAIN_2 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pfam | PF00439--Bromodomain |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | GO:0003677--F:DNA binding |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthology |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Created Date | 25-Jun-2016 |