Classification:      Me_Reader      Chromodomain

※ Chromodomain family introduction

    Chromodomain: The chromodomain is the smallest member, consisting of four curved β-strands and an α-helix. The chromodomains of HP1 and Polycomb were found to recognize histone H3 trimethylated at K9 (H3K9me3) and H3K27me3, respectively, and these proteins were the first examples of readers specific for methyllysine. Chromodomains generally prefer trimethylated lysine, though some have been shown to bind dimethylated species. The aromatic cage of the chromodomain of mouse and fly HP1 contains an aspartate or glutamate residue, accounting for its ability to interact well with H3K9me3 and dimethylated H3K9 (H3K9me2). (1)

Reference
1. Musselman CA, Lalonde ME, Cote J, Kutateladze TG.Perceiving the epigenetic landscape through histone readers. Nat Struct Mol Biol.2012;19(12):1218-27. PMID: 23211769.


    Me_Reader Chromodomain 

  Ailuropoda melanoleuca (6)  Anas platyrhynchos (4)  Anolis carolinensis (8)
  Arabidopsis lyrata (1)  Arabidopsis thaliana (3)  Astyanax mexicanus (9)
  Bos taurus (8)  Brassica rapa (1)  Caenorhabditis elegans (1)
  Callithrix jacchus (9)  Canis familiaris (9)  Cavia porcellus (10)
  Chlorocebus sabaeus (9)  Choloepus hoffmanni (3)  Ciona intestinalis (2)
  Danio rerio (10)  Dasypus novemcinctus (6)  Dipodomys ordii (6)
  Drosophila melanogaster (1)  Echinops telfairi (5)  Equus caballus (6)
  Erinaceus europaeus (5)  Felis catus (7)  Ficedula albicollis (3)
  Gadus morhua (11)  Gallus gallus (3)  Gasterosteus aculeatus (12)
  Gorilla gorilla (11)  Homo sapiens (13)  Ictidomys tridecemlineatus (9)
  Latimeria chalumnae (8)  Lepisosteus oculatus (8)  Loxodonta africana (8)
  Macaca mulatta (5)  Macropus eugenii (2)  Meleagris gallopavo (2)
  Microcebus murinus (5)  Monodelphis domestica (8)  Mus musculus (10)
  Mustela putorius furo (6)  Myotis lucifugus (8)  Nomascus leucogenys (7)
  Ochotona princeps (3)  Oreochromis niloticus (12)  Ornithorhynchus anatinus (2)
  Oryctolagus cuniculus (8)  Oryzias latipes (11)  Otolemur garnettii (11)
  Ovis aries (5)  Pan troglodytes (14)  Papio anubis (7)
  Pelodiscus sinensis (4)  Petromyzon marinus (3)  Poecilia formosa (12)
  Pongo abelii (8)  Procavia capensis (4)  Pteropus vampyrus (6)
  Rattus norvegicus (12)  Sarcophilus harrisii (6)  Schizosaccharomyces pombe (1)
  Selaginella moellendorffii (2)  Setaria italica (1)  Sorex araneus (2)
  Sus scrofa (5)  Taeniopygia guttata (4)  Takifugu rubripes (12)
  Tarsius syrichta (3)  Tetraodon nigroviridis (11)  Tupaia belangeri (6)
  Tursiops truncatus (9)  Vicugna pacos (2)  Xenopus tropicalis (9)
  Xiphophorus maculatus (11)  Zea mays (1)