Classification:      HMT      SET1

※ SET1 family introduction

    SET1: The SET1 gene in the budding yeast Saccharomyces cerevisiae was discovered by several laboratories as encoding the first known H3K4 methyltransferase, a catalytic function performed through its conserved SET domain. Yeast Set1, like its orthologs in higher eukaryotes (SET1A/B in humans), is recruited to chromatin by the serine 5-phosphorylated C-terminal domain of RNA polymerase II (pol II). This interaction with the initiating form of pol II results in the occupancy of Set1 near the 5’-end of active genes, which correlates closely with the peak of H3K4me3. (1)

    In metazoans, SET1A/B proteins seem to function analogously to yeast Set1 in performing the majority of transcription-coupled H3K4 methylation found at active genes, presumably through co-transcriptional recruitment. Unlike their yeast counterpart, human SET1A/B proteins are also recruited to chromatin via an interaction with non-methylated CpG island sequences, mediated by the SET1A/B-associated protein CFP1.

Reference
1. Ernst P, Vakoc CR.WRAD: enabler of the SET1-family of H3K4 methyltransferases. Brief Funct Genomics.2012;11(3):217-226. PMID: 22652693.


    HMT SET1 

  Aegilops tauschii (12)  Ailuropoda melanoleuca (16)  Amborella trichopoda (13)
  Anas platyrhynchos (12)  Anolis carolinensis (14)  Arabidopsis lyrata (17)
  Arabidopsis thaliana (12)  Ashbya gossypii (2)  Aspergillus clavatus (3)
  Aspergillus flavus (3)  Aspergillus fumigatus (3)  Aspergillus nidulans (2)
  Aspergillus niger (2)  Aspergillus oryzae (2)  Aspergillus terreus (3)
  Astyanax mexicanus (19)  Bos taurus (15)  Brachypodium distachyon (18)
  Brassica oleracea (24)  Brassica rapa (22)  Caenorhabditis elegans (3)
  Callithrix jacchus (14)  Candida albicans (2)  Candida glabrata (2)
  Canis familiaris (16)  Cavia porcellus (15)  Chaetomium globosum (3)
  Chlamydomonas reinhardtii (4)  Chlorocebus sabaeus (15)  Choloepus hoffmanni (5)
  Ciona intestinalis (8)  Ciona savignyi (7)  Coccidioides immitis (3)
  Cryptococcus neoformans (2)  Cyanidioschyzon merolae (4)  Danio rerio (20)
  Dasypus novemcinctus (15)  Dipodomys ordii (11)  Drosophila melanogaster (4)
  Echinops telfairi (7)  Equus caballus (15)  Erinaceus europaeus (7)
  Felis catus (15)  Ficedula albicollis (12)  Fusarium oxysporum (2)
  Gadus morhua (17)  Gaeumannomyces graminis (3)  Gallus gallus (13)
  Gasterosteus aculeatus (20)  Glycine max (37)  Gorilla gorilla (18)
  Homo sapiens (9)  Hordeum vulgare (12)  Ictidomys tridecemlineatus (14)
  Kluyveromyces lactis (2)  Komagataella pastoris (2)  Laccaria bicolor (2)
  Latimeria chalumnae (15)  Leersia perrieri (13)  Lepisosteus oculatus (11)
  Leptosphaeria maculans (3)  Loxodonta africana (15)  Macaca mulatta (13)
  Macropus eugenii (9)  Magnaporthe oryzae (2)  Magnaporthe poae (2)
  Medicago truncatula (22)  Melampsora laricipopulina (1)  Meleagris gallopavo (11)
  Microbotryum violaceum (2)  Microcebus murinus (9)  Monodelphis domestica (16)
  Mus musculus (14)  Musa acuminata (19)  Mustela putorius furo (14)
  Myotis lucifugus (14)  Neurospora crassa (2)  Nomascus leucogenys (14)
  Ochotona princeps (10)  Oreochromis niloticus (16)  Ornithorhynchus anatinus (10)
  Oryctolagus cuniculus (15)  Oryza barthii (12)  Oryza brachyantha (14)
  Oryza glaberrima (14)  Oryza glumaepatula (13)  Oryza indica (16)
  Oryza longistaminata (11)  Oryza meridionalis (13)  Oryza nivara (12)
  Oryza punctata (13)  Oryza rufipogon (12)  Oryza sativa (12)
  Oryzias latipes (16)  Ostreococcus lucimarinus (4)  Otolemur garnettii (15)
  Ovis aries (16)  Pan troglodytes (15)  Papio anubis (16)
  Pelodiscus sinensis (14)  Petromyzon marinus (7)  Phaeosphaeria nodorum (3)
  Physcomitrella patens (20)  Poecilia formosa (20)  Pongo abelii (15)
  Populus trichocarpa (26)  Procavia capensis (12)  Prunus persica (14)
  Pteropus vampyrus (13)  Puccinia graminis (2)  Puccinia triticina (1)
  Pyrenophora teres (3)  Pyrenophora triticirepentis (3)  Rattus norvegicus (19)
  Saccharomyces cerevisiae (1)  Sarcophilus harrisii (17)  Schizosaccharomyces japonicus (2)
  Schizosaccharomyces pombe (1)  Sclerotinia sclerotiorum (3)  Selaginella moellendorffii (24)
  Setaria italica (16)  Solanum lycopersicum (20)  Solanum tuberosum (11)
  Sorex araneus (9)  Sorghum bicolor (13)  Sporisorium reilianum (2)
  Sus scrofa (15)  Taeniopygia guttata (15)  Takifugu rubripes (20)
  Tarsius syrichta (9)  Tetraodon nigroviridis (19)  Theobroma cacao (15)
  Trichoderma reesei (3)  Trichoderma virens (3)  Triticum aestivum (39)
  Triticum urartu (10)  Tuber melanosporum (3)  Tupaia belangeri (8)
  Tursiops truncatus (13)  Ustilago maydis (2)  Verticillium dahliae (2)
  Vicugna pacos (4)  Vitis vinifera (15)  Xenopus tropicalis (11)
  Xiphophorus maculatus (20)  Yarrowia lipolytica (2)  Zea mays (14)
  Zymoseptoria tritici (4)