Classification:      HDM      JmjC_only

※ JmjC_only family introduction

    JmjC_only: The seventh group that we discuss contains several JmjC domain- containing proteins that, apart from the JmjC domain, contain no other recognizable protein domains. This group forms its own branch that is based on homology within the JmjC domain, and includes all of the JmjC-domain proteins that are known to localize to the cytoplasm (FIH, PLA2G4B and HSPBAP1). We propose that these proteins, of which only the MINA53/NO66 group (see below) has orthologues in yeast, might have diverged in higher eukaryotes to carry out functions that are independent of histone demethylation. (1)

Reference
1. Klose RJ,Kallin EM,Zhang Y (2012)JmjC-domain-containing proteins and histone demethylation. Nat Rev Genet., 7:715-727. PMID: 16983801.


    HDM JmjC_only 

  Ailuropoda melanoleuca (4)  Anas platyrhynchos (4)  Anolis carolinensis (3)
  Arabidopsis lyrata (1)  Arabidopsis thaliana (1)  Astyanax mexicanus (3)
  Bos taurus (4)  Brachypodium distachyon (1)  Brassica oleracea (1)
  Brassica rapa (1)  Caenorhabditis elegans (2)  Callithrix jacchus (2)
  Canis familiaris (4)  Cavia porcellus (3)  Chlorocebus sabaeus (3)
  Choloepus hoffmanni (1)  Ciona intestinalis (2)  Ciona savignyi (2)
  Danio rerio (3)  Dasypus novemcinctus (4)  Dipodomys ordii (2)
  Drosophila melanogaster (2)  Echinops telfairi (1)  Equus caballus (4)
  Erinaceus europaeus (1)  Felis catus (4)  Ficedula albicollis (4)
  Gadus morhua (4)  Gallus gallus (4)  Gasterosteus aculeatus (2)
  Glycine max (2)  Gorilla gorilla (4)  Homo sapiens (4)
  Hordeum vulgare (1)  Ictidomys tridecemlineatus (4)  Latimeria chalumnae (4)
  Leersia perrieri (1)  Lepisosteus oculatus (4)  Loxodonta africana (4)
  Macaca mulatta (4)  Macropus eugenii (2)  Medicago truncatula (1)
  Meleagris gallopavo (3)  Microcebus murinus (3)  Monodelphis domestica (4)
  Mus musculus (4)  Musa acuminata (2)  Mustela putorius furo (4)
  Myotis lucifugus (3)  Nomascus leucogenys (3)  Ochotona princeps (3)
  Oreochromis niloticus (3)  Ornithorhynchus anatinus (2)  Oryctolagus cuniculus (3)
  Oryza brachyantha (2)  Oryza glumaepatula (1)  Oryza indica (1)
  Oryza nivara (1)  Oryza rufipogon (1)  Oryza sativa (2)
  Oryzias latipes (3)  Otolemur garnettii (4)  Ovis aries (4)
  Pan troglodytes (4)  Papio anubis (4)  Pelodiscus sinensis (3)
  Petromyzon marinus (2)  Poecilia formosa (3)  Pongo abelii (2)
  Populus trichocarpa (1)  Procavia capensis (3)  Prunus persica (1)
  Pteropus vampyrus (1)  Rattus norvegicus (4)  Sarcophilus harrisii (4)
  Schizosaccharomyces pombe (2)  Selaginella moellendorffii (2)  Setaria italica (1)
  Solanum tuberosum (1)  Sorghum bicolor (1)  Sus scrofa (2)
  Taeniopygia guttata (3)  Takifugu rubripes (3)  Tarsius syrichta (2)
  Tetraodon nigroviridis (3)  Theobroma cacao (1)  Triticum aestivum (1)
  Triticum urartu (1)  Tupaia belangeri (3)  Tursiops truncatus (3)
  Vicugna pacos (1)  Vitis vinifera (1)  Xenopus tropicalis (3)
  Xiphophorus maculatus (2)  Zea mays (1)