Classification:      HDM      JHDM3_JMJD2

※ JHDM3_JMJD2 family introduction

    JHDM3_JMJD2: The JHDM3_JMJD2 group of proteins has orthologues from yeast to humans. In higher eukaryotes, proteins of this family contain JmjN, PHD and Tudor domains in addition to the JmjC domain. There are four JHDM3_JMJD2 genes (JHDM3A_JMJD2A, JMJD2B, JMJD2C and JMJD2D) in the human genome, each of which has orthologues in the mouse. JHDM3A_JMJD2A was originally identified as a transcriptional repressor associated with the NCoR corepressor complex, but has also been shown to physically interact with RB to repress E2F target genes. More recently, it was suggested that the tandem Tudor domain of JHDM3A_JMJD2A potentially contains a chromatin targeting module that directly binds methylated H3K4, H3K9 and H4K20. (1)

Reference
1. Klose RJ,Kallin EM,Zhang Y (2008)JmjC-domain-containing proteins and histone demethylation. Nat Rev Genet., 7:715-727. PMID: 16983801.


    HDM JHDM3_JMJD2 

  Ailuropoda melanoleuca (4)  Amborella trichopoda (2)  Anas platyrhynchos (2)
  Anolis carolinensis (3)  Arabidopsis lyrata (3)  Arabidopsis thaliana (2)
  Ashbya gossypii (1)  Aspergillus clavatus (1)  Aspergillus flavus (1)
  Aspergillus fumigatus (1)  Aspergillus nidulans (1)  Aspergillus niger (1)
  Aspergillus oryzae (1)  Aspergillus terreus (1)  Astyanax mexicanus (4)
  Bos taurus (3)  Brachypodium distachyon (2)  Brassica oleracea (2)
  Brassica rapa (2)  Caenorhabditis elegans (1)  Callithrix jacchus (4)
  Candida albicans (1)  Candida glabrata (1)  Canis familiaris (4)
  Cavia porcellus (9)  Chaetomium globosum (1)  Chlorocebus sabaeus (5)
  Choloepus hoffmanni (2)  Ciona intestinalis (1)  Ciona savignyi (1)
  Coccidioides immitis (1)  Cryptococcus neoformans (1)  Danio rerio (4)
  Dasypus novemcinctus (2)  Dipodomys ordii (2)  Drosophila melanogaster (2)
  Echinops telfairi (3)  Equus caballus (3)  Erinaceus europaeus (1)
  Felis catus (3)  Ficedula albicollis (3)  Fusarium oxysporum (1)
  Gadus morhua (3)  Gaeumannomyces graminis (1)  Gallus gallus (3)
  Gasterosteus aculeatus (4)  Glycine max (6)  Gorilla gorilla (4)
  Homo sapiens (7)  Hordeum vulgare (1)  Ictidomys tridecemlineatus (5)
  Kluyveromyces lactis (1)  Komagataella pastoris (1)  Laccaria bicolor (1)
  Latimeria chalumnae (3)  Leersia perrieri (2)  Lepisosteus oculatus (3)
  Leptosphaeria maculans (1)  Loxodonta africana (4)  Macaca mulatta (4)
  Macropus eugenii (1)  Magnaporthe oryzae (1)  Magnaporthe poae (1)
  Medicago truncatula (2)  Melampsora laricipopulina (1)  Meleagris gallopavo (2)
  Microbotryum violaceum (1)  Microcebus murinus (2)  Monodelphis domestica (3)
  Mus musculus (4)  Musa acuminata (3)  Mustela putorius furo (4)
  Myotis lucifugus (8)  Neurospora crassa (1)  Nomascus leucogenys (5)
  Ochotona princeps (3)  Oreochromis niloticus (4)  Ornithorhynchus anatinus (1)
  Oryctolagus cuniculus (3)  Oryza barthii (3)  Oryza brachyantha (2)
  Oryza glaberrima (3)  Oryza glumaepatula (3)  Oryza indica (3)
  Oryza longistaminata (1)  Oryza meridionalis (2)  Oryza nivara (3)
  Oryza punctata (3)  Oryza rufipogon (3)  Oryza sativa (2)
  Oryzias latipes (3)  Otolemur garnettii (4)  Ovis aries (5)
  Pan troglodytes (5)  Papio anubis (5)  Pelodiscus sinensis (3)
  Phaeosphaeria nodorum (1)  Physcomitrella patens (1)  Poecilia formosa (4)
  Pongo abelii (3)  Populus trichocarpa (3)  Prunus persica (1)
  Pteropus vampyrus (3)  Puccinia graminis (1)  Puccinia triticina (1)
  Pyrenophora teres (1)  Pyrenophora triticirepentis (1)  Rattus norvegicus (5)
  Saccharomyces cerevisiae (2)  Sarcophilus harrisii (3)  Sclerotinia sclerotiorum (1)
  Selaginella moellendorffii (2)  Setaria italica (2)  Solanum lycopersicum (1)
  Solanum tuberosum (1)  Sorex araneus (2)  Sorghum bicolor (1)
  Sporisorium reilianum (1)  Sus scrofa (6)  Taeniopygia guttata (3)
  Takifugu rubripes (4)  Tetraodon nigroviridis (4)  Theobroma cacao (2)
  Trichoderma reesei (1)  Trichoderma virens (1)  Triticum aestivum (2)
  Triticum urartu (1)  Tuber melanosporum (1)  Tupaia belangeri (3)
  Tursiops truncatus (2)  Ustilago maydis (1)  Verticillium dahliae (1)
  Vicugna pacos (2)  Vitis vinifera (1)  Xenopus tropicalis (2)
  Xiphophorus maculatus (3)  Yarrowia lipolytica (1)  Zea mays (1)
  Zymoseptoria tritici (1)