Classification:      HDM      JHDM1

※ JHDM1 family introduction

    JHDM1: Members of the JHDM1 group are found in organisms from budding yeast to human. In addition to the JmjC domain, the human, mouse and D. melanogaster JHDM1 orthologues contain leucine-rich repeats (LRRs), an F-box domain and a CXXC zinc-finger domain. Using a novel activity-based histone demethylase assay, we recently identified the JHDM1 family of histone demethylases, and showed that the JmjC domain can specifically mediate Fe(II) and αKG-dependent histone demethylation. Both human JHDM1 homologues (JHDM1A and JHDM1B) and their orthologue from budding yeast are H3K36 histone demethylases. Little is known about the biological function of JHDM1 proteins, although the C. elegans orthologue can suppress spontaneous mutations and the fission yeast orthologue functions to limit heterochromatic domains at the mating type locus. (1)

Reference
1. Klose RJ,Kallin EM,Zhang Y (2006)JmjC-domain-containing proteins and histone demethylation. Nat Rev Genet., 7:715-727. PMID: 16983801.


    HDM JHDM1 

  Ailuropoda melanoleuca (2)  Anas platyrhynchos (2)  Anolis carolinensis (2)
  Astyanax mexicanus (3)  Bos taurus (2)  Caenorhabditis elegans (1)
  Callithrix jacchus (2)  Canis familiaris (2)  Cavia porcellus (2)
  Chlorocebus sabaeus (2)  Ciona intestinalis (1)  Ciona savignyi (1)
  Danio rerio (3)  Dasypus novemcinctus (2)  Dipodomys ordii (1)
  Drosophila melanogaster (1)  Echinops telfairi (1)  Equus caballus (2)
  Erinaceus europaeus (1)  Felis catus (2)  Ficedula albicollis (2)
  Gadus morhua (3)  Gallus gallus (2)  Gasterosteus aculeatus (3)
  Homo sapiens (2)  Ictidomys tridecemlineatus (1)  Latimeria chalumnae (1)
  Lepisosteus oculatus (1)  Loxodonta africana (2)  Macaca mulatta (2)
  Macropus eugenii (1)  Meleagris gallopavo (2)  Microcebus murinus (2)
  Monodelphis domestica (2)  Mus musculus (2)  Mustela putorius furo (2)
  Myotis lucifugus (2)  Nomascus leucogenys (2)  Ochotona princeps (2)
  Oreochromis niloticus (3)  Ornithorhynchus anatinus (1)  Oryctolagus cuniculus (2)
  Oryzias latipes (3)  Otolemur garnettii (2)  Ovis aries (2)
  Pan troglodytes (2)  Papio anubis (2)  Pelodiscus sinensis (2)
  Poecilia formosa (4)  Pongo abelii (1)  Procavia capensis (1)
  Pteropus vampyrus (1)  Rattus norvegicus (1)  Saccharomyces cerevisiae (1)
  Sarcophilus harrisii (2)  Schizosaccharomyces pombe (1)  Sorex araneus (1)
  Sus scrofa (1)  Taeniopygia guttata (2)  Takifugu rubripes (3)
  Tarsius syrichta (1)  Tetraodon nigroviridis (3)  Tupaia belangeri (1)
  Vicugna pacos (1)  Xenopus tropicalis (2)  Xiphophorus maculatus (3)