Classification:      HDAC      HD2

※ HD2 family introduction



    HD2: Plants possess a family of HDAC proteins, the HD2 family, which is not found in animals or fungi and is distantly related to cis-trans isomerases found in insects, S.cerevisiae and parasitic apicomplexans. Using maize HD2 as a query, four candidate proteins, HDT1, HDT2, HDT3 and HDT4, were identified in the Arabidopsis proteome. The conserved N-terminus of these proteins contains the HD2-type HDAC domain of approximately 100 amino acids. The proteins are comprised of a conserved N-terminal domain, a central acidic domain and variant C-terminal domain. (1)

Reference
1. Pandey R, Müller A, Napoli CA, Selinger DA, Pikaard CS, Richards EJ, Bender J, Mount DW, Jorgensen RA. Analysis of histone acetyltransferase and histone deacetylase families ofArabidopsis thalianasuggests functional diversification of chromatin modification among multicellular eukaryotes. Nucleic Acids Res.2002;30(23):5036-5055. PMID: 12466527.


    HDAC HD2 

  Aegilops tauschii (1)  Amborella trichopoda (1)  Anolis carolinensis (1)
  Arabidopsis lyrata (4)  Arabidopsis thaliana (4)  Ashbya gossypii (1)
  Brachypodium distachyon (1)  Brassica oleracea (3)  Brassica rapa (3)
  Caenorhabditis elegans (2)  Chaetomium globosum (1)  Chlamydomonas reinhardtii (1)
  Cyanidioschyzon merolae (1)  Danio rerio (1)  Felis catus (1)
  Glycine max (1)  Hordeum vulgare (1)  Latimeria chalumnae (1)
  Leersia perrieri (1)  Leptosphaeria maculans (1)  Macaca mulatta (1)
  Magnaporthe poae (1)  Medicago truncatula (1)  Meleagris gallopavo (1)
  Microcebus murinus (1)  Monodelphis domestica (1)  Musa acuminata (2)
  Oryza barthii (2)  Oryza brachyantha (1)  Oryza glaberrima (1)
  Oryza glumaepatula (1)  Oryza indica (1)  Oryza longistaminata (1)
  Oryza meridionalis (2)  Oryza nivara (1)  Oryza punctata (1)
  Oryza rufipogon (1)  Oryza sativa (1)  Ostreococcus lucimarinus (1)
  Phaeosphaeria nodorum (1)  Physcomitrella patens (1)  Populus trichocarpa (2)
  Prunus persica (2)  Puccinia graminis (2)  Sclerotinia sclerotiorum (2)
  Selaginella moellendorffii (1)  Setaria italica (1)  Solanum lycopersicum (2)
  Solanum tuberosum (2)  Sorghum bicolor (2)  Taeniopygia guttata (1)
  Tetraodon nigroviridis (1)  Theobroma cacao (1)  Trichoderma reesei (1)
  Triticum aestivum (1)  Triticum urartu (1)  Tupaia belangeri (1)
  Tursiops truncatus (1)  Vitis vinifera (1)  Zea mays (2)