Classification:      HDAC      Class-II

※ Class-II family introduction

    Class-II: Class II HDACs share homology with yeast Hda1, and are sub-classified into Classes IIa and IIb. The former group contains HDACs 4, 5, 7, and 9, and HDACs 6 and 10 belong to group IIb. (1)

    Class IIa HDACs shuttle between the nucleus and cytoplasm, This group of HDACs regulate the activity of transcription factors. Class IIb HDACs seem to have primarily cytoplasmic roles, with HDAC6 deacetylatingalpha-tubulin and functioning as part of protein aggresome formation and processing.

Reference
1. Koeneke, E., Witt, O., & Oehme, I.HDAC Family Members Intertwined in the Regulation of Autophagy: A Druggable Vulnerability in Aggressive Tumor Entities. Cells.2015;4(2):135-168. PMID: 25915736.


    HDAC Class-II 

  Aegilops tauschii (3)  Ailuropoda melanoleuca (6)  Amborella trichopoda (2)
  Anas platyrhynchos (4)  Anolis carolinensis (5)  Arabidopsis lyrata (5)
  Arabidopsis thaliana (5)  Ashbya gossypii (1)  Aspergillus clavatus (1)
  Aspergillus fumigatus (1)  Aspergillus nidulans (1)  Aspergillus oryzae (1)
  Aspergillus terreus (1)  Astyanax mexicanus (5)  Bos taurus (6)
  Brachypodium distachyon (2)  Brassica oleracea (6)  Brassica rapa (5)
  Caenorhabditis elegans (3)  Callithrix jacchus (6)  Candida albicans (1)
  Candida glabrata (1)  Canis familiaris (6)  Cavia porcellus (6)
  Chaetomium globosum (1)  Chlamydomonas reinhardtii (1)  Chlorocebus sabaeus (5)
  Choloepus hoffmanni (1)  Ciona intestinalis (1)  Ciona savignyi (1)
  Coccidioides immitis (1)  Cryptococcus neoformans (1)  Danio rerio (6)
  Dasypus novemcinctus (4)  Dipodomys ordii (5)  Drosophila melanogaster (2)
  Echinops telfairi (4)  Equus caballus (6)  Erinaceus europaeus (4)
  Felis catus (5)  Ficedula albicollis (4)  Fusarium oxysporum (1)
  Gadus morhua (5)  Gaeumannomyces graminis (1)  Gallus gallus (4)
  Gasterosteus aculeatus (5)  Glycine max (4)  Gorilla gorilla (6)
  Homo sapiens (6)  Hordeum vulgare (2)  Ictidomys tridecemlineatus (6)
  Kluyveromyces lactis (1)  Komagataella pastoris (1)  Laccaria bicolor (1)
  Latimeria chalumnae (5)  Leersia perrieri (3)  Lepisosteus oculatus (5)
  Leptosphaeria maculans (1)  Loxodonta africana (5)  Macaca mulatta (6)
  Macropus eugenii (5)  Magnaporthe oryzae (1)  Magnaporthe poae (1)
  Medicago truncatula (3)  Melampsora laricipopulina (1)  Meleagris gallopavo (4)
  Microbotryum violaceum (1)  Microcebus murinus (4)  Monodelphis domestica (4)
  Mus musculus (5)  Musa acuminata (3)  Mustela putorius furo (6)
  Myotis lucifugus (6)  Neurospora crassa (1)  Nomascus leucogenys (5)
  Ochotona princeps (4)  Oreochromis niloticus (7)  Ornithorhynchus anatinus (3)
  Oryctolagus cuniculus (6)  Oryza barthii (4)  Oryza brachyantha (2)
  Oryza glaberrima (4)  Oryza glumaepatula (2)  Oryza indica (2)
  Oryza longistaminata (2)  Oryza nivara (3)  Oryza punctata (3)
  Oryza rufipogon (3)  Oryza sativa (3)  Oryzias latipes (6)
  Ostreococcus lucimarinus (1)  Otolemur garnettii (5)  Ovis aries (6)
  Pan troglodytes (6)  Papio anubis (6)  Pelodiscus sinensis (5)
  Petromyzon marinus (3)  Phaeosphaeria nodorum (1)  Physcomitrella patens (4)
  Poecilia formosa (8)  Pongo abelii (6)  Populus trichocarpa (3)
  Procavia capensis (4)  Prunus persica (3)  Pteropus vampyrus (5)
  Puccinia graminis (1)  Puccinia triticina (1)  Pyrenophora teres (1)
  Pyrenophora triticirepentis (1)  Rattus norvegicus (7)  Saccharomyces cerevisiae (2)
  Sarcophilus harrisii (5)  Schizosaccharomyces japonicus (1)  Schizosaccharomyces pombe (1)
  Selaginella moellendorffii (4)  Setaria italica (2)  Solanum lycopersicum (2)
  Solanum tuberosum (1)  Sorex araneus (2)  Sorghum bicolor (2)
  Sporisorium reilianum (1)  Sus scrofa (5)  Taeniopygia guttata (3)
  Takifugu rubripes (7)  Tarsius syrichta (2)  Tetraodon nigroviridis (6)
  Theobroma cacao (2)  Trichoderma reesei (1)  Trichoderma virens (1)
  Triticum aestivum (6)  Triticum urartu (3)  Tuber melanosporum (1)
  Tupaia belangeri (2)  Tursiops truncatus (6)  Ustilago maydis (1)
  Verticillium dahliae (1)  Vicugna pacos (1)  Vitis vinifera (3)
  Xenopus tropicalis (5)  Xiphophorus maculatus (7)  Yarrowia lipolytica (1)
  Zea mays (2)  Zymoseptoria tritici (1)