WERAM Information
Tag | Content | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
WERAM ID | WERAM-Hos-0051 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein ID | ENSP00000212015.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Uniprot Accession | Q96EB6; SIR1_HUMAN; Q2XNF6; Q5JVQ0; Q9GZR9; Q9Y6F0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Protein ID | NP_001135970.1; NP_001300978.1; NP_036370.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Nucleotide ID | NM_001142498.1; NM_001314049.1; NM_012238.4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | SIRT1;SIR2L1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Information |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Details |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Reviewed | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Classification |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NCBI Taxa ID | 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Functional Description (View) |
NAD-dependent protein deacetylase that links transcriptional regulation directly to intracellular energetics and participates in the coordination of several separated cellular functions such as cell cycle, response to DNA damage, metobolism, apoptosis and autophagy. Can modulate chromatin function through deacetylation of histones and can promote alterations in the methylation of histones and DNA, leading to transcriptional repression. Deacetylates a broad range of transcription factors and coregulators, thereby regulating target gene expression positively and negatively. Serves as a sensor of the cytosolic ratio of NAD(+)/NADH which is altered by glucose deprivation and metabolic changes associated with caloric restriction. Is essential in skeletal muscle cell differentiation and in response to low nutrients mediates the inhibitory effect on skeletal myoblast differentiation which also involves 5'-AMP-activated protein kinase (AMPK) and nicotinamide phosphoribosyltransferase (NAMPT). Component of the eNoSC (energy-dependent nucleolar silencing) complex, a complex that mediates silencing of rDNA in response to intracellular energy status and acts by recruiting histone-modifying enzymes. The eNoSC complex is able to sense the energy status of cell: upon glucose starvation, elevation of NAD(+)/NADP(+) ratio activates SIRT1, leading to histone H3 deacetylation followed by dimethylation of H3 at 'Lys-9' (H3K9me2) by SUV39H1 and the formation of silent chromatin in the rDNA locus. Deacetylates 'Lys-266' of SUV39H1, leading to its activation. Inhibits skeletal muscle differentiation by deacetylating PCAF and MYOD1. Deacetylates H2A and 'Lys-26' of HIST1H1E. Deacetylates 'Lys-16' of histone H4 (in vitro). Involved in NR0B2/SHP corepression function through chromatin remodeling: Recruited to LRH1 target gene promoters by NR0B2/SHP thereby stimulating histone H3 and H4 deacetylation leading to transcriptional repression. Proposed to contribute to genomic integrity via positive regulation of telomere length; however, reports on localization to pericentromeric heterochromatin are conflicting. Proposed to play a role in constitutive heterochromatin (CH) formation and/or maintenance through regulation of the available pool of nuclear SUV39H1. Upon oxidative/metabolic stress decreases SUV39H1 degradation by inhibiting SUV39H1 polyubiquitination by MDM2. This increase in SUV39H1 levels enhances SUV39H1 turnover in CH, which in turn seems to accelerate renewal of the heterochromatin which correlates with greater genomic integrity during stress response. Deacetylates 'Lys-382' of p53/TP53 and impairs its ability to induce transcription-dependent proapoptotic program and modulate cell senescence. Deacetylates TAF1B and thereby represses rDNA transcription by the RNA polymerase I. Deacetylates MYC, promotes the association of MYC with MAX and decreases MYC stability leading to compromised transformational capability. Deacetylates FOXO3 in response to oxidative stress thereby increasing its ability to induce cell cycle arrest and resistance to oxidative stress but inhibiting FOXO3-mediated induction of apoptosis transcriptional activity; also leading to FOXO3 ubiquitination and protesomal degradation. Appears to have a similar effect on MLLT7/FOXO4 in regulation of transcriptional activity and apoptosis. Deacetylates DNMT1; thereby impairs DNMT1 methyltransferase-independent transcription repressor activity, modulates DNMT1 cell cycle regulatory function and DNMT1-mediated gene silencing. Deacetylates RELA/NF-kappa-B p65 thereby inhibiting its transactivating potential and augments apoptosis in response to TNF-alpha. Deacetylates HIF1A, KAT5/TIP60, RB1 and HIC1. Deacetylates FOXO1 resulting in its nuclear retention and enhancement of its transcriptional activity leading to increased gluconeogenesis in liver. Inhibits E2F1 transcriptional activity and apoptotic function, possibly by deacetylation. Involved in HES1- and HEY2-mediated transcriptional repression. In cooperation with MYCN seems to be involved in transcriptional repression of DUSP6/MAPK3 leading to MYCN stabilization by phosphorylation at 'Ser-62'. Deacetylates MEF2D. Required for antagonist-mediated transcription suppression of AR-dependent genes which may be linked to local deacetylation of histone H3. Represses HNF1A-mediated transcription. Required for the repression of ESRRG by CREBZF. Modulates AP-1 transcription factor activity. Deacetylates NR1H3 AND NR1H2 and deacetylation of NR1H3 at 'Lys-434' positively regulates transcription of NR1H3:RXR target genes, promotes NR1H3 proteosomal degradation and results in cholesterol efflux; a promoter clearing mechanism after reach round of transcription is proposed. Involved in lipid metabolism. Implicated in regulation of adipogenesis and fat mobilization in white adipocytes by repression of PPARG which probably involves association with NCOR1 and SMRT/NCOR2. Deacetylates ACSS2 leading to its activation, and HMGCS1. Involved in liver and muscle metabolism. Through deacteylation and activation of PPARGC1A is required to activate fatty acid oxidation in skeletel muscle under low-glucose conditions and is involved in glucose homeostasis. Involved in regulation of PPARA and fatty acid beta-oxidation in liver. Involved in positive regulation of insulin secretion in pancreatic beta cells in response to glucose; the function seems to imply transcriptional repression of UCP2. Proposed to deacetylate IRS2 thereby facilitating its insulin-induced tyrosine phosphorylation. Deacetylates SREBF1 isoform SREBP-1C thereby decreasing its stability and transactivation in lipogenic gene expression. Involved in DNA damage response by repressing genes which are involved in DNA repair, such as XPC and TP73, deacetylating XRCC6/Ku70, and faciliting recruitment of additional factors to sites of damaged DNA, such as SIRT1-deacetylated NBN can recruit ATM to initiate DNA repair and SIRT1-deacetylated XPA interacts with RPA2. Also involved in DNA repair of DNA double-strand breaks by homologous recombination and specifically single-strand annealing independently of XRCC6/Ku70 and NBN. Transcriptional suppression of XPC probably involves an E2F4:RBL2 suppressor complex and protein kinase B (AKT) signaling. Transcriptional suppression of TP73 probably involves E2F4 and PCAF. Deacetylates WRN thereby regulating its helicase and exonuclease activities and regulates WRN nuclear translocation in response to DNA damage. Deacetylates APEX1 at 'Lys-6' and 'Lys-7' and stimulates cellular AP endonuclease activity by promoting the association of APEX1 to XRCC1. Increases p53/TP53-mediated transcription-independent apoptosis by blocking nuclear translocation of cytoplasmic p53/TP53 and probably redirecting it to mitochondria. Deacetylates XRCC6/Ku70 at 'Lys-539' and 'Lys-542' causing it to sequester BAX away from mitochondria thereby inhibiting stress-induced apoptosis. Is involved in autophagy, presumably by deacetylating ATG5, ATG7 and MAP1LC3B/ATG8. Deacetylates AKT1 which leads to enhanced binding of AKT1 and PDK1 to PIP3 and promotes their activation. Proposed to play role in regulation of STK11/LBK1-dependent AMPK signaling pathways implicated in cellular senescence which seems to involve the regulation of the acetylation status of STK11/LBK1. Can deacetylate STK11/LBK1 and thereby increase its activity, cytoplasmic localization and association with STRAD; however, the relevance of such activity in normal cells is unclear. In endothelial cells is shown to inhibit STK11/LBK1 activity and to promote its degradation. Deacetylates SMAD7 at 'Lys-64' and 'Lys-70' thereby promoting its degradation. Deacetylates CIITA and augments its MHC class II transactivation and contributes to its stability. Deacteylates MECOM/EVI1. Deacetylates PML at 'Lys-487' and this deacetylation promotes PML control of PER2 nuclear localization. During the neurogenic transition, repress selective NOTCH1-target genes through histone deacetylation in a BCL6-dependent manner and leading to neuronal differentiation. Regulates the circadian expression of several core clock genes, including ARNTL/BMAL1, RORC, PER2 and CRY1 and plays a critical role in maintaining a controlled rhythmicity in histone acetylation, thereby contributing to circadian chromatin remodeling. Deacetylates ARNTL/BMAL1 and histones at the circadian gene promoters in order to facilitate repression by inhibitory components of the circadian oscillator. Deacetylates PER2, facilitating its ubiquitination and degradation by the proteosome. Protects cardiomyocytes against palmitate-induced apoptosis (PubMed:11672523, PubMed:12006491, PubMed:14976264, PubMed:14980222, PubMed:15126506, PubMed:15152190, PubMed:15205477, PubMed:15469825, PubMed:15692560, PubMed:16079181, PubMed:16166628, PubMed:16892051, PubMed:16998810, PubMed:17283066, PubMed:17334224, PubMed:17505061, PubMed:17612497, PubMed:17620057, PubMed:17936707, PubMed:18203716, PubMed:18296641, PubMed:18662546, PubMed:18687677, PubMed:19188449, PubMed:19220062, PubMed:19364925, PubMed:19690166, PubMed:19934257, PubMed:20097625, PubMed:20100829, PubMed:20203304, PubMed:20375098, PubMed:20620956, PubMed:20670893, PubMed:20817729, PubMed:21149730, PubMed:21245319, PubMed:21471201, PubMed:21504832, PubMed:21555002, PubMed:21698133, PubMed:21701047, PubMed:21775285, PubMed:21807113, PubMed:21841822, PubMed:21890893, PubMed:21909281, PubMed:21947282, PubMed:22274616). Deacetylates XBP1 isoform 2; deacetylation decreases protein stability of XBP1 isoform 2 and inhibits its transcriptional activity (PubMed:20955178). Involved in the CCAR2-mediated regulation of PCK1 and NR1D1 (PubMed:24415752). Deacetylates CTNB1 at 'Lys-49' (PubMed:24824780). In POMC (pro-opiomelanocortin) neurons, required for leptin-induced activation of PI3K signaling (By similarity). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Domain Profile | HDAC SIR2 SIR2.txt 2 klakllkkskkivvltGAGiStsaGIPDFRsseGlysklkke..elpspeaifdldffrkdpkvfyalakelyplgsakPtktHyflaelek 91 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Sequence (Fasta) | MADEAALALQ PGGSPSAAGA DREAASSPAG EPLRKRPRRD GPGLERSPGE PGGAAPEREV 60 PAAARGCPGA AAAALWREAE AEAAAAGGEQ EAQATAAAGE GDNGPGLQGP SREPPLADNL 120 YDEDDDDEGE EEEEAAAAAI GYRDNLLFGD EIITNGFHSC ESDEEDRASH ASSSDWTPRP 180 RIGPYTFVQQ HLMIGTDPRT ILKDLLPETI PPPELDDMTL WQIVINILSE PPKRKKRKDI 240 NTIEDAVKLL QECKKIIVLT GAGVSVSCGI PDFRSRDGIY ARLAVDFPDL PDPQAMFDIE 300 YFRKDPRPFF KFAKEIYPGQ FQPSLCHKFI ALSDKEGKLL RNYTQNIDTL EQVAGIQRII 360 QCHGSFATAS CLICKYKVDC EAVRGDIFNQ VVPRCPRCPA DEPLAIMKPE IVFFGENLPE 420 QFHRAMKYDK DEVDLLIVIG SSLKVRPVAL IPSSIPHEVP QILINREPLP HLHFDVELLG 480 DCDVIINELC HRLGGEYAKL CCNPVKLSEI TEKPPRTQKE LAYLSELPPT PLHVSEDSSS 540 PERTSPPDSS VIVTLLDQAA KSNDDLDVSE SKGCMEEKPQ EVQTSRNVES IAEQMENPDL 600 KNVGSSTGEK NERTSVAGTV RKCWPNRVAK EQISRRLDGN QYLFLPPNRY IFHGAEVYSD 660 SEDDVLSSSS CGSNSDSGTC QSPSLEEPME DESEIEEFYN GLEDEPDVPE RAGGAGFGTD 720 GDDQEAINEA ISVKQEVTDM NYPSNKS 747 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Nucleotide Sequence (Fasta) | GTCGAGCGGG AGCAGAGGAG GCGAGGGAGG AGGGCCAGAG AGGCAGTTGG AAGATGGCGG 60 ACGAGGCGGC CCTCGCCCTT CAGCCCGGCG GCTCCCCCTC GGCGGCGGGG GCCGACAGGG 120 AGGCCGCGTC GTCCCCCGCC GGGGAGCCGC TCCGCAAGAG GCCGCGGAGA GATGGTCCCG 180 GCCTCGAGCG GAGCCCGGGC GAGCCCGGTG GGGCGGCCCC AGAGCGTGAG GTGCCGGCGG 240 CGGCCAGGGG CTGCCCGGGT GCGGCGGCGG CGGCGCTGTG GCGGGAGGCG GAGGCAGAGG 300 CGGCGGCGGC AGGCGGGGAG CAAGAGGCCC AGGCGACTGC GGCGGCTGGG GAAGGAGACA 360 ATGGGCCGGG CCTGCAGGGC CCATCTCGGG AGCCACCGCT GGCCGACAAC TTGTACGACG 420 AAGACGACGA CGACGAGGGC GAGGAGGAGG AAGAGGCGGC GGCGGCGGCG ATTGGGTACC 480 GAGATAACCT TCTGTTCGGT GATGAAATTA TCACTAATGG TTTTCATTCC TGTGAAAGTG 540 ATGAGGAGGA TAGAGCCTCA CATGCAAGCT CTAGTGACTG GACTCCAAGG CCACGGATAG 600 GTCCATATAC TTTTGTTCAG CAACATCTTA TGATTGGCAC AGATCCTCGA ACAATTCTTA 660 AAGATTTATT GCCGGAAACA ATACCTCCAC CTGAGTTGGA TGATATGACA CTGTGGCAGA 720 TTGTTATTAA TATCCTTTCA GAACCACCAA AAAGGAAAAA AAGAAAAGAT ATTAATACAA 780 TTGAAGATGC TGTGAAATTA CTGCAAGAGT GCAAAAAAAT TATAGTTCTA ACTGGAGCTG 840 GGGTGTCTGT TTCATGTGGA ATACCTGACT TCAGGTCAAG GGATGGTATT TATGCTCGCC 900 TTGCTGTAGA CTTCCCAGAT CTTCCAGATC CTCAAGCGAT GTTTGATATT GAATATTTCA 960 GAAAAGATCC AAGACCATTC TTCAAGTTTG CAAAGGAAAT ATATCCTGGA CAATTCCAGC 1020 CATCTCTCTG TCACAAATTC ATAGCCTTGT CAGATAAGGA AGGAAAACTA CTTCGCAACT 1080 ATACCCAGAA CATAGACACG CTGGAACAGG TTGCGGGAAT CCAAAGGATA ATTCAGTGTC 1140 ATGGTTCCTT TGCAACAGCA TCTTGCCTGA TTTGTAAATA CAAAGTTGAC TGTGAAGCTG 1200 TACGAGGAGA TATTTTTAAT CAGGTAGTTC CTCGATGTCC TAGGTGCCCA GCTGATGAAC 1260 CGCTTGCTAT CATGAAACCA GAGATTGTGT TTTTTGGTGA AAATTTACCA GAACAGTTTC 1320 ATAGAGCCAT GAAGTATGAC AAAGATGAAG TTGACCTCCT CATTGTTATT GGGTCTTCCC 1380 TCAAAGTAAG ACCAGTAGCA CTAATTCCAA GTTCCATACC CCATGAAGTG CCTCAGATAT 1440 TAATTAATAG AGAACCTTTG CCTCATCTGC ATTTTGATGT AGAGCTTCTT GGAGACTGTG 1500 ATGTCATAAT TAATGAATTG TGTCATAGGT TAGGTGGTGA ATATGCCAAA CTTTGCTGTA 1560 ACCCTGTAAA GCTTTCAGAA ATTACTGAAA AACCTCCACG AACACAAAAA GAATTGGCTT 1620 ATTTGTCAGA GTTGCCACCC ACACCTCTTC ATGTTTCAGA AGACTCAAGT TCACCAGAAA 1680 GAACTTCACC ACCAGATTCT TCAGTGATTG TCACACTTTT AGACCAAGCA GCTAAGAGTA 1740 ATGATGATTT AGATGTGTCT GAATCAAAAG GTTGTATGGA AGAAAAACCA CAGGAAGTAC 1800 AAACTTCTAG GAATGTTGAA AGTATTGCTG AACAGATGGA AAATCCGGAT TTGAAGAATG 1860 TTGGTTCTAG TACTGGGGAG AAAAATGAAA GAACTTCAGT GGCTGGAACA GTGAGAAAAT 1920 GCTGGCCTAA TAGAGTGGCA AAGGAGCAGA TTAGTAGGCG GCTTGATGGT AATCAGTATC 1980 TGTTTTTGCC ACCAAATCGT TACATTTTCC ATGGCGCTGA GGTATATTCA GACTCTGAAG 2040 ATGACGTCTT ATCCTCTAGT TCTTGTGGCA GTAACAGTGA TAGTGGGACA TGCCAGAGTC 2100 CAAGTTTAGA AGAACCCATG GAGGATGAAA GTGAAATTGA AGAATTCTAC AATGGCTTAG 2160 AAGATGAGCC TGATGTTCCA GAGAGAGCTG GAGGAGCTGG ATTTGGGACT GATGGAGATG 2220 ATCAAGAGGC AATTAATGAA GCTATATCTG TGAAACAGGA AGTAACAGAC ATGAACTATC 2280 CATCAAACAA ATCATAGTGT AATAATTGTG CAGGTACAGG AATTGTTCCA CCAGCATTAG 2340 GAACTTTAGC ATGTCAAAAT GAATGTTTAC TTGTGAACTC GATAGAGCAA GGAAACCAGA 2400 AAGGTGTAAT ATTTATAGGT TGGTAAAATA GATTGTTTTT CATGGATAAT TTTTAACTTC 2460 ATTATTTCTG TACTTGTACA AACTCAACAC TAACTTTTTT TTTTTTAAAA AAAAAAAGGT 2520 ACTAAGTATC TTCAATCAGC TGTTGGTCAA GACTAACTTT CTTTTAAAGG TTCATTTGTA 2580 TGATAAATTC ATATGTGTAT ATATAATTTT TTTTGTTTTG TCTAGTGAGT TTCAACATTT 2640 TTAAAGTTTT CAAAAAGCCA TCGGAATGTT AAATTAATGT AAAGGGAACA GCTAATCTAG 2700 ACCAAAGAAT GGTATTTTCA CTTTTCTTTG TAACATTGAA TGGTTTGAAG TACTCAAAAT 2760 CTGTTACGCT AAACTTTTGA TTCTTTAACA CAATTATTTT TAAACACTGG CATTTTCCAA 2820 AACTGTGGCA GCTAACTTTT TAAAATCTCA AATGACATGC AGTGTGAGTA GAAGGAAGTC 2880 AACAATATGT GGGGAGAGCA CTCGGTTGTC TTTACTTTTA AAAGTAATAC TTGGTGCTAA 2940 GAATTTCAGG ATTATTGTAT TTACGTTCAA ATGAAGATGG CTTTTGTACT TCCTGTGGAC 3000 ATGTAGCAAT GTCTATATTG GCTCATAAAA CTAACCTGAA AAACAAATAA ATGCTTTGGA 3060 AATGTTTCAG TTGCTTTAGA AACATTAGTG CCTGCCTGGA TCCCCTTAGT TTTGAAATAT 3120 TTGCCATTGT TGTTTAAATA CCTATCACTG TGGTAGAGCT TGCATTGATC TTTTCCACAA 3180 GTATTAAACT GCCAAAATGT GAATATGCAA AGCCTTTCTG AATCTATAAT AATGGTACTT 3240 CTACTGGGGA GAGTGTAATA TTTTGGACTG CTGTTTTCCA TTAATGAGGA GAGCAACAGG 3300 CCCCTGATTA TACAGTTCCA AAGTAATAAG ATGTTAATTG TAATTCAGCC AGAAAGTACA 3360 TGTCTCCCAT TGGGAGGATT TGGTGTTAAA TACCAAACTG CTAGCCCTAG TATTATGGAG 3420 ATGAACATGA TGATGTAACT TGTAATAGCA GAATAGTTAA TGAATGAAAC TAGTTCTTAT 3480 AATTTATCTT TATTTAAAAG CTTAGCCTGC CTTAAAACTA GAGATCAACT TTCTCAGCTG 3540 CAAAAGCTTC TAGTCTTTCA AGAAGTTCAT ACTTTATGAA ATTGCACAGT AAGCATTTAT 3600 TTTTCAGACC ATTTTTGAAC ATCACTCCTA AATTAATAAA GTATTCCTCT GTTGCTTTAG 3660 TATTTATTAC AATAAAAAGG GTTTGAAATA TAGCTGTTCT TTATGCATAA AACACCCAGC 3720 TAGGACCATT ACTGCCAGAG AAAAAAATCG TATTGAATGG CCATTTCCCT ACTTATAAGA 3780 TGTCTCAATC TGAATTTATT TGGCTACACT AAAGAATGCA GTATATTTAG TTTTCCATTT 3840 GCATGATGTT TGTGTGCTAT AGATGATATT TTAAATTGAA AAGTTTGTTT TAAATTATTT 3900 TTACAGTGAA GACTGTTTTC AGCTCTTTTT ATATTGTACA TAGTCTTTTA TGTAATTTAC 3960 TGGCATATGT TTTGTAGACT GTTTAATGAC TGGATATCTT CCTTCAACTT TTGAAATACA 4020 AAACCAGTGT TTTTTACTTG TACACTGTTT TAAAGTCTAT TAAAATTGTC ATTTGACTTT 4080 TTTCTGTTAA CTTA 4095 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence Source | Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Keyword | KW-0002--3D-structure |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interpro | IPR029035--DHS-like_NAD/FAD-binding_dom |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PROSITE | PS50305--SIRTUIN |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pfam | PF02146--SIR2 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | GO:0005677--C:chromatin silencing complex |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthology |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Created Date | 25-Jun-2016 |