WERAM Information
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WERAM ID | WERAM-Art-0050 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein ID | AT2G33290.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Uniprot Accession | O22781; SUVH2_ARATH | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Protein ID | NP_180887.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | Histone-lysine N-methyltransferase family member SUVH2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Nucleotide ID | NM_128889.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | SUVH2;SET3;SDG3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Information |
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Details |
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Status | Reviewed | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Classification |
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Organism | Arabidopsis thaliana | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NCBI Taxa ID | 3702 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Functional Description (View) |
Histone methyltransferase family member. According to PubMed:15775980, it is required for normal methylation of 'Lys-9' and 'Lys-27' of histone H3, 'Lys-20' of H4, and cytosine, but PubMed:19043555 see no significant effect on histone methylation when the gene is mutated. According to PubMed:19043555, the protein does not bind S-adenosyl-L-methionine and lacks methyltransferase activity. Instead, it may function downstream of DRM2 in RNA-directed DNA methylation, binding to methylated DNA and recruiting DNA-directed RNA polymerase V to chromatin (PubMed:24463519). Plays a central role in gene silencing. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Domain Profile | HMT SUV39 SUV39.txt 2 rLqvfktenkGwGvrclddiakgsFvciyaGeiltddeaekegleegdeyladldskesv..enlkegyesdvplssdssntrqekdkeeseyiidak 97 |
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Protein Sequence (Fasta) | MSTLLPFPDL NLMPDSQSST AGTTAGDTVV TGKLEVKSEP IEEWQTPPSS TSDQSANTDL 60 IAEFIRISEL FRSAFKPLQV KGLDGVSVYG LDSGAIVAVP EKENRELIEP PPGFKDNRVS 120 TVVVSPKFER PRELARIAIL GHEQRKELRQ VMKRTRMTYE SLRIHLMAES MKNHVLGQGR 180 RRRSDMAAAY IMRDRGLWLN YDKHIVGPVT GVEVGDIFFY RMELCVLGLH GQTQAGIDCL 240 TAERSATGEP IATSIVVSGG YEDDEDTGDV LVYTGHGGQD HQHKQCDNQR LVGGNLGMER 300 SMHYGIEVRV IRGIKYENSI SSKVYVYDGL YKIVDWWFAV GKSGFGVFKF RLVRIEGQPM 360 MGSAVMRFAQ TLRNKPSMVR PTGYVSFDLS NKKENVPVFL YNDVDGDQEP RHYEYIAKAV 420 FPPGIFGQGG ISRTGCECKL SCTDDCLCAR KNGGEFAYDD NGHLLKGKHV VFECGEFCTC 480 GPSCKSRVTQ KGLRNRLEVF RSKETGWGVR TLDLIEAGAF ICEYAGVVVT RLQAEILSMN 540 GDVMVYPGRF TDQWRNWGDL SQVYPDFVRP NYPSLPPLDF SMDVSRMRNV ACYISHSKEP 600 NVMVQFVLHD HNHLMFPRVM LFALENISPL AELSLDYGLA DEVNGKLAIC N 651 |
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Nucleotide Sequence (Fasta) | TTGAGACAAC CTCGAAGTAA TGCAAACACT TTAAGGCCGG ATCCGATTCG TGACCCGAAT 60 AGTTTCCGGA TTCGGAGCCC AGGTGTTGTT TCTGTCTTCG GTTCATTGGG AAGGATGAGT 120 ACATTGTTAC CATTTCCTGA CCTCAACCTC ATGCCGGATT CTCAATCCTC CACCGCCGGA 180 ACCACAGCCG GCGACACTGT AGTCACCGGA AAGTTAGAAG TGAAATCGGA ACCAATTGAG 240 GAATGGCAAA CTCCACCATC GTCTACCTCC GATCAATCAG CCAATACCGA TCTCATCGCC 300 GAGTTTATTC GTATCTCAGA GCTCTTCCGC TCGGCATTCA AGCCACTGCA GGTCAAAGGA 360 TTAGACGGAG TCTCCGTATA CGGATTGGAT TCTGGTGCCA TCGTTGCTGT ACCGGAGAAA 420 GAAAACCGGG AATTGATTGA ACCGCCTCCA GGATTTAAGG ATAATCGAGT CTCCACCGTC 480 GTTGTCTCGC CGAAATTCGA GAGACCGAGA GAGCTAGCGA GAATTGCAAT TCTAGGTCAT 540 GAACAACGGA AGGAACTCCG ACAAGTCATG AAACGAACTA GGATGACTTA TGAGTCTCTT 600 CGGATTCATC TAATGGCGGA GAGTATGAAG AATCATGTAC TTGGTCAAGG GCGTAGACGG 660 AGGAGCGATA TGGCGGCTGC GTATATAATG AGGGATCGGG GACTGTGGTT GAACTATGAT 720 AAGCACATAG TTGGTCCAGT CACAGGGGTT GAAGTAGGGG ATATATTCTT CTACCGTATG 780 GAATTGTGTG TGCTGGGCTT ACACGGCCAG ACACAAGCCG GGATTGATTG TTTAACGGCT 840 GAACGGAGCG CCACTGGAGA GCCTATAGCT ACCAGCATTG TTGTCTCAGG TGGTTATGAG 900 GATGATGAAG ATACAGGAGA TGTTTTGGTT TATACTGGTC ACGGTGGTCA GGATCATCAA 960 CACAAGCAGT GTGATAACCA GAGGCTAGTA GGTGGGAATC TGGGAATGGA GAGAAGTATG 1020 CACTACGGTA TCGAGGTACG TGTGATTAGA GGTATTAAGT ATGAGAACAG TATAAGCTCG 1080 AAGGTGTATG TATATGATGG TTTGTATAAG ATAGTAGATT GGTGGTTTGC TGTGGGGAAG 1140 TCTGGTTTTG GGGTTTTTAA ATTTAGGTTA GTAAGAATTG AAGGGCAACC GATGATGGGC 1200 AGTGCGGTAA TGAGGTTTGC ACAAACTCTT AGAAATAAGC CATCGATGGT TAGGCCTACT 1260 GGTTATGTTA GCTTTGACCT TTCTAACAAG AAGGAGAATG TACCCGTGTT TCTATATAAT 1320 GATGTAGATG GTGATCAAGA ACCGAGACAT TATGAGTACA TTGCAAAAGC TGTCTTTCCT 1380 CCTGGAATTT TTGGTCAGGG GGGGATCAGC AGGACTGGCT GCGAGTGTAA GCTCTCTTGT 1440 ACTGATGATT GTCTCTGTGC AAGGAAGAAC GGTGGTGAGT TTGCATATGA TGATAACGGG 1500 CATCTATTGA AAGGAAAGCA TGTGGTATTT GAATGTGGGG AATTCTGCAC TTGTGGTCCG 1560 AGCTGTAAGA GCCGTGTGAC ACAGAAGGGA TTGAGGAACA GGCTAGAGGT TTTCAGATCG 1620 AAGGAAACCG GTTGGGGTGT CAGGACACTT GATCTAATTG AAGCTGGTGC TTTCATATGC 1680 GAATATGCAG GTGTAGTTGT CACGAGACTT CAAGCCGAGA TTCTGTCAAT GAATGGGGAT 1740 GTTATGGTCT ATCCTGGTCG GTTCACAGAC CAATGGCGTA ACTGGGGTGA TTTATCTCAA 1800 GTATACCCAG ATTTTGTTAG GCCGAATTAT CCATCTCTCC CTCCACTGGA TTTCTCAATG 1860 GATGTGTCAA GGATGAGGAA CGTGGCTTGC TACATTAGTC ACAGCAAAGA ACCAAATGTG 1920 ATGGTGCAAT TTGTTTTGCA TGACCACAAT CACCTGATGT TCCCCCGTGT GATGCTTTTT 1980 GCGCTGGAGA ATATCTCACC GTTGGCCGAG CTAAGCCTGG ATTACGGCTT GGCAGATGAA 2040 GTGAACGGCA AGCTCGCCAT CTGCAACTAG TTTTTACAAA GTTTGTTTTT GTGCTATAGC 2100 TTGAGCCTTG AGATGGAGAA AATTTTGATC AAAGCCTTTC TCTGCTCGTT TGTTGTTATG 2160 TCTTCCAACC TTTCTGTGAA GCAAGAATGG GAGGCATGGT CGGTGAGTGT TCTGCATCCA 2220 TTTTTTGGGG GTAAAAACTT CTCTTTGTCA AATGTGTTTG TACTTTTGTT CTGTTATTAA 2280 TGTACTGAAA TTTTTGTATG TTTCTCTCTC CCCCTTATGT TAGAGCTTAA GCTGATATAT 2340 2341 |
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Sequence Source | Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Keyword | KW-0137--Centromere |
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Interpro | IPR025794--Hist-Lys_N-MeTrfase_plant |
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PROSITE | PS50867--PRE_SET |
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Pfam | PF05033--Pre-SET |
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Gene Ontology | GO:0000775--C:chromosome, centromeric region |
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Orthology |
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Created Date | 25-Jun-2016 |