WERAM Information
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WERAM ID | WERAM-Pot-0117 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein ID | POPTR_0010s15260.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | POPTR_0010s15260g | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Information |
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Status | Unreviewed | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Classification |
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Organism | Populus trichocarpa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Domain Profile | Ac_Reader Bromodomain BROMO.txt 27 kePmdLstikerleegnYsspeefvkDvrlifnNakaynen 67 |
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Protein Sequence (Fasta) | MMPLSFSSKE REIAQLAESE TSRRRVKDVD VDLSEVYFLI MHFLSAGPCQ RTYVQFWNEL 60 LEHQLLPRRY HAWYSRSGAH SGDENDENDN GLSFPLSYNS LEEQYPHIEK NHLVKLLKQL 120 LLNTASPSEG LIGDAPNAAD VPTLLGTGSF SLLSCDRDKG NDQVKHPPAH MRWPHRHADQ 180 VRGLSLREIG GGFARHHRAP SIRAACYAIA KPSTMVQKMQ NVKRVRGHRN AVYCAIFDRS 240 GRYVVTGSDD RLVKIWSMET AFCLASCRGH EGDITDLAVN SNNTLVASSS NDCIIRVWRL 300 PDGMPISVLR GHSAAVTAIA FSPRPGSAYQ LLSSSNLGTR IYVPRPPDPV AGKNSGPSTS 360 SGPQSHQIFC CAFNAHGTVF VTGSSDHLAR VWNALKSNTD DSAQPNHEID VLPGHENDVN 420 YVQFSGCAMP SRFSMADNSK EENIPKFKNS WYFHESIVTC SRDGSAIIWI PKSRRSHGKA 480 GRWIRHYHLK VPPPPMPTQP PRGGPRQRIL PTPRGVNMIA WSLDNRFVLA AIMDCRICVW 540 NAADGSLVHS LTGHTQSTYV LDVHPFNPRI AMSAGYDGKT IVWDIWEGTP IRIYEISHFK 600 LVDGKFSPDG TSIILSDDVG QLYILNTGQG ESQKDAKYDQ FFLGDYRPLI QDTYGNVLDQ 660 ETQQVPFRRN MQDLLCDSGM IPYTEPYQSM YQQRRLGALG VEWKPSSVRF AVGPDFSLDP 720 DNQMLALADL DVLVEPLPDF IDAMDWEPEN DMQSDENDSE YNAPEENSSE AEQGRSNYSS 780 SGDPECSAED SEAEGRDGFR GSKRRKQKAE IQIMTSSGRR VKRKNLDECD GNSIRSNRTR 840 KSRIDRKASK RKSSTSKALR PQRAAARNAL SLFSKITGTA TDAEDEDGSE GDLSETESGM 900 QDSNIESDES DRSLHDEGNR NLKGKDILEE PEDFAKYHEF TESHMNTINR RRLVLKLPVH 960 DSSKIVLPEC GMHKGDSQVD LVGSSSKAPQ EATEVNGVPT SSQDPGYFSG DAHCSRMDGG 1020 RRAQIKNYPL DLSEEYKNGD IRWGGVKART FKRQRLGESI SSAAYTGSSA CLGEHNENEN 1080 NLNRYSKLQE DNGTISPTLE VQNNTDKGVV PVNGRNAGAD TFELVNDVSN GEEHPTFNGC 1140 LDSDKLPTLG HMVNGNDNPP DLRESLPPFS TKIRIRSKKI LKDSLDNQGN GRCDLSTDKP 1200 ANMTQNPVKE MLENNGSNGI APEYKGDGLE ESDTQIGEIS MPSLDNSSGS RSDPKRMFDV 1260 VYRRSKPGRG RISSEGDGSI REDTLSACDP HLDFRGDSYE GASGGSHRTR SMGLKAPTHD 1320 SNMASNNLQL EQGHESDDTC RDALNNSINR CQLSCEEWGS SSRMTARLRS TRNRKASYHF 1380 RDTSPVDGRK LHQSAKKASW LMLSMHEEGS RYIPQQGDEV AYLRQGHQEY LDRMKSKEAG 1440 PWKIMKGNIR AVEFCKVEAL EYAALAGSGD CCCKMTLRFV DPTSSTFQKS FKLTLPEMTG 1500 FPDFLVERTR FDAAIQRNWS RRDKCKVWWK NEGEEDGDWW HGRVLYTKPK SSEFPDSPWE 1560 RCTVQYKSDP KELHEHSPWE LFDDDTQLEQ PRIDEEITNK LLSAFAKLER SGKKDQDHYG 1620 VEKLRQVSQK SNFINRFPVP LSLEVIQSRL ENNYYRSLEA LKHDFEVVLS NAESHFEKNA 1680 ELSIKMRRLS NWFARTLSSL |
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Nucleotide Sequence (Fasta) | GAAACATTGC TCTCCAGAAG TACATTCCTT CAAGGGATGC ACCTTCAGGC AGTATGATGC 60 CTTTGAGCTT TTCCAGTAAG GAGCGTGAGA TTGCTCAACT TGCAGAGTCA GAGACAAGTC 120 GCAGAAGGGT GAAAGATGTG GATGTTGACC TTAGTGAAGT TTACTTTTTA ATTATGCATT 180 TCCTTTCAGC TGGGCCATGT CAGAGAACTT ATGTACAGTT TTGGAATGAA CTTCTCGAAC 240 ATCAACTTTT ACCTAGAAGA TATCATGCTT GGTATTCAAG AAGTGGAGCA CATAGTGGGG 300 ATGAAAATGA TGAAAATGAT AATGGTCTAT CATTTCCATT AAGTTACAAT AGTTTGGAGG 360 AGCAGTACCC TCACATTGAG AAGAATCACT TGGTAAAGCT TTTGAAGCAA TTATTGCTCA 420 ACACAGCCTC TCCATCAGAA GGCTTGATTG GTGATGCTCC AAATGCTGCT GATGTTCCTA 480 CCCTTCTGGG AACGGGTTCA TTTTCACTTT TGAGTTGTGA TAGAGATAAG GGAAATGACC 540 AAGTCAAGCA CCCCCCTGCT CACATGCGAT GGCCTCATAG ACATGCTGAT CAGGTTCGCG 600 GGTTAAGTTT GAGGGAAATT GGAGGTGGTT TTGCAAGACA CCATCGTGCA CCTTCTATTC 660 GTGCAGCATG CTATGCTATT GCGAAACCAT CAACTATGGT ACAGAAAATG CAAAATGTCA 720 AGAGAGTACG CGGACATCGG AATGCTGTCT ATTGTGCAAT ATTTGATCGC TCTGGGAGAT 780 ATGTTGTCAC TGGTTCAGAC GATCGTCTTG TAAAAATCTG GTCCATGGAA ACTGCTTTTT 840 GCTTAGCTAG CTGTCGGGGG CATGAAGGGG ACATTACTGA CTTGGCTGTA AATTCAAACA 900 ATACCTTGGT GGCATCCTCT TCAAATGATT GCATAATTCG AGTTTGGCGT TTGCCAGATG 960 GGATGCCAAT ATCAGTTCTA CGTGGACACT CTGCAGCTGT TACTGCCATT GCATTTAGTC 1020 CAAGGCCTGG TTCTGCATAC CAGCTTTTGT CGTCTTCCAA CTTAGGTACA CGGATATATG 1080 TTCCAAGGCC TCCAGATCCT GTGGCTGGAA AGAACAGTGG TCCGTCCACA AGTAGTGGTC 1140 CTCAGAGCCA TCAGATTTTT TGTTGTGCAT TCAATGCTCA TGGAACTGTA TTTGTCACTG 1200 GTAGCTCTGA CCACCTTGCT AGGGTGTGGA ATGCTCTTAA ATCCAACACG GATGATTCAG 1260 CCCAGCCAAA TCATGAGATA GATGTGTTAC CTGGCCACGA GAATGATGTC AACTATGTCC 1320 AATTTAGTGG TTGTGCCATG CCATCTAGAT TTTCTATGGC TGACAACTCA AAGGAAGAAA 1380 ATATTCCAAA ATTTAAAAAT TCATGGTATT TTCACGAAAG CATTGTTACC TGTTCTCGAG 1440 ACGGCAGTGC AATTATTTGG ATTCCAAAAT CACGTAGATC ACATGGTAAA GCTGGCCGTT 1500 GGATACGGCA TTATCATCTG AAAGTTCCTC CTCCACCAAT GCCTACTCAA CCTCCACGAG 1560 GAGGTCCACG ACAGAGAATT CTTCCAACTC CTCGTGGGGT AAACATGATT GCGTGGAGTC 1620 TGGATAATCG TTTTGTCCTT GCTGCTATCA TGGATTGCAG AATATGTGTT 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Sequence Source | Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthology |
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Created Date | 25-Jun-2016 |