WERAM Information
Tag | Content | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
WERAM ID | WERAM-Pot-0043 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein ID | POPTR_0004s03270.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | POPTR_0004s03270g | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Information |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Unreviewed | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Classification |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Populus trichocarpa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Domain Profile | HDM JHDM2 JHDM2.txt 6 dgklNLasklpknfvrpdlgPklynAyGlateedrklgttnlhldvsdavnilvy.vgilkkkwaeedlkellksieeeeldevtrkrvqd 95 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Sequence (Fasta) | MIKNPFSLSF PHFTLSNKSK LSVTFPRKSG FSGKISKLSL LMEPLPDHLR CKRTDGRQWR 60 CNRRVMEDKK LCEIHHLQGR HRQYRRKVPE TLKLQRKKSK KSSASSSNFE ALSRVSLKEG 120 KLGKFKKKGK KLKRGDLQLD LIRMVLQREM EKRKNKKTKG FSEKESVNNG EEEGEGEELM 180 RDLPNGFMAI SPAKNFGNGN VGSCSGSHVD VKVGGGGFNG VNTARRCFRS KNIEPMPVGK 240 LQDLSKERSK VDKVLHFHYL ICMLLPILKQ INQDQSIEIE IEAKIKVDFH RTCPDCSYSL 300 CLSCCQDIFH GSLHGSVKDS SDNLLYYPTI MDIRGDNLEH FQKHWGRGQP VIVRNVLQST 360 SDVSWDPMVM FCNYLKNNAA RSQNGQATDC LDWFEVEIGV KQMFMGSFKG LTNGNIWHEK 420 LKLKGWLSSN LFQEHFPAHY TDILQALPLP EYMDPISGVL NIAAELPQET LKPDLGPCLY 480 ISYGSGESLA QADSVTKLRY NSYDVVNILA HTTDVPVSTK QLNYMRKLMT KHKEQNKESN 540 REMFHDGDSD SDSDTDTDTE VSKFFFGPVK SSRTSDNLKF YGKHSESSNN FRMKKLSESC 600 GAQWDVFRRQ DVPKLAEYLR RHFNEFTYTY GLQKHMVHPI LDQNFFLDAS HKMRLKEEFK 660 IEPWSFEQHV GEAVIIPAGC PYQIRNLKSC VSVVLDFLSP ENVTECIQLI DELRQLPENH 720 KAKVDSLEVK KMALHSISRA VKEIRELTCA E 751 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Nucleotide Sequence (Fasta) | GTGACCATAA TTCAAGATTT CCTTTTCCTT ATCCCAAAAT CCTCCTATCC TTTTCTTCAT 60 AATTACACCA CTTGCCACTC CCACACTCCC ATGATAAAAA ATCCCTTCTC ACTCTCATTC 120 CCTCACTTCA CTCTATCTAA TAAATCCAAA CTTTCTGTCA CTTTCCCGAG AAAATCAGGA 180 TTTTCCGGGA AAATTTCCAA ACTTTCTCTT TTAATGGAGC CGCTACCGGA CCATCTCCGG 240 TGCAAGAGGA CAGACGGCCG GCAATGGCGG TGCAACCGGC GGGTGATGGA GGATAAGAAG 300 CTCTGTGAAA TTCATCACCT TCAGGGCCGC CATAGGCAGT ATAGGAGGAA AGTGCCCGAG 360 ACTTTGAAGT TGCAGAGAAA GAAGAGCAAG AAATCATCAG CATCAAGTTC TAATTTTGAA 420 GCCCTAAGTA GGGTTTCTTT GAAAGAGGGC AAATTAGGGA AATTTAAGAA GAAAGGAAAG 480 AAATTGAAGA GGGGAGATTT ACAGCTGGAT TTGATAAGGA TGGTTTTACA GAGAGAAATG 540 GAGAAGAGAA AGAATAAGAA AACGAAAGGG TTTTCAGAGA AAGAGAGTGT TAATAATGGT 600 GAAGAAGAAG GTGAAGGGGA AGAGTTAATG AGAGATTTGC CAAATGGGTT CATGGCAATA 660 TCACCTGCCA AGAATTTTGG GAATGGCAAT GTGGGTTCTT GTTCTGGTTC ACATGTTGAC 720 GTTAAGGTTG GAGGGGGTGG TTTCAATGGG GTTAATACTG CTAGAAGATG TTTTAGGTCT 780 AAAAATATTG AGCCAATGCC AGTTGGGAAA TTACAGGACC TGTCCAAGGA GAGAAGTAAA 840 GTTGACAAGG TTCTGCATTT TCATTATTTA ATCTGTATGC TTCTTCCTAT ACTGAAACAA 900 ATAAATCAAG ATCAGAGCAT TGAGATAGAA ATAGAAGCAA AAATAAAAGT GGATTTCCAT 960 AGGACCTGCC CTGATTGTTC CTATAGCCTT TGCTTAAGTT GTTGTCAGGA TATTTTTCAT 1020 GGGAGCTTAC ATGGAAGTGT TAAAGATTCT AGCGATAACC TTTTATATTA TCCAACCATT 1080 ATGGATATTC GTGGTGATAA CCTTGAACAC TTTCAGAAGC ACTGGGGCAG AGGTCAACCT 1140 GTAATTGTTC GTAATGTGCT TCAGAGTACA TCTGATGTGA GCTGGGATCC AATGGTCATG 1200 TTCTGCAATT ATCTTAAGAA TAATGCTGCC AGATCTCAAA ATGGGCAAGC TACAGATTGT 1260 TTGGACTGGT TTGAGGTAGA AATTGGTGTA AAACAGATGT TTATGGGGTC TTTTAAGGGT 1320 CTGACAAATG GCAACATATG GCATGAGAAG CTAAAATTGA AGGGTTGGCT TTCTTCTAAT 1380 TTATTCCAAG AACATTTTCC TGCCCATTAC ACTGACATCC TTCAGGCTCT ACCACTTCCA 1440 GAATACATGG ACCCCATCTC TGGTGTTCTA AACATTGCTG CAGAGTTGCC GCAGGAAACC 1500 TTGAAGCCTG ATCTGGGTCC TTGTCTCTAT ATATCATATG GAAGTGGTGA GAGTCTTGCA 1560 CAGGCCGATT CTGTGACAAA ATTGCGTTAT AATTCATATG ATGTGGTTAA TATTTTGGCA 1620 CATACAACTG ATGTCCCTGT ATCTACAAAA CAGCTTAATT ACATGAGAAA GTTGATGACA 1680 AAGCACAAGG AACAGAATAA AGAGAGCAAT CGAGAAATGT TTCATGATGG GGATTCAGAT 1740 TCTGATTCTG ACACTGATAC TGATACTGAA GTATCAAAAT TTTTCTTTGG ACCTGTTAAA 1800 AGTTCAAGGA CATCAGATAA TCTTAAGTTT TATGGGAAGC ACTCCGAGAG CTCCAATAAT 1860 TTCAGAATGA AAAAACTCTC TGAGTCTTGT GGTGCCCAAT GGGATGTCTT TCGTAGACAG 1920 GATGTTCCCA AGCTTGCAGA ATACCTTAGA AGGCACTTTA ATGAGTTCAC TTACACATAT 1980 GGCTTACAAA AGCATATGGT TCATCCAATA CTTGATCAGA ATTTCTTTCT TGATGCATCT 2040 CATAAAATGA GACTTAAGGA GGAATTCAAA ATTGAACCCT GGAGTTTTGA GCAACATGTT 2100 GGAGAAGCAG TGATTATTCC TGCTGGATGC CCTTACCAAA TTAGGAATCT TAAGTCATGC 2160 GTCAGTGTGG TTTTGGACTT CCTCTCACCA GAAAATGTTA CTGAATGCAT CCAGCTGATT 2220 GATGAGTTAC GACAACTTCC AGAGAACCAT AAAGCCAAAG TAGACAGTTT AGAGGTGAAG 2280 AAAATGGCAT TGCACAGTAT TAGTAGAGCA GTCAAAGAAA TTCGTGAGCT TACATGCGCA 2340 GAGTAAATCC TCATTGAAAT ACATGAATTC AGGGCCAGCA TGGATCTCAA CGACTAACTG 2400 CAAGGACTAA AAATGGATAG ATAATCATAG CAGGGAAGGA TCTGACATGG TGGCATTTGA 2460 GCTTCTGCTG TTATTTCTAG ATGATTGTGC AGGGTATTTT GGTTTCTGCA TCAGCATGTT 2520 TTTTTGCATC CAGAAATTTT GATAGATTCC TCCTCCTTGG TCATTAAAAA GTAATTTTAT 2580 CTCATGGTGC AAAACACCAA TTTTTCCAGA TCAAAGATTG GCATTCATGG TCATTTCAGC 2640 AACAGCTTGT ACATGTGTTC ATTAAGATTA GCATTTTTTT TCTCCTTACT GCAACAGCAT 2700 GTATATATGA TAGATCCATT TGGCTGTATA TGATGATTAA TCCATTTGTT TTTAATAGTG 2760 ATTGATCCTT TCGGGTTTTT TATACAACGT TGAGACGGTT TCTGCGGTCA TATTATTATA 2820 ATTTAATTTT GACCCCCTAT TTTT 2845 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence Source | Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthology |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Created Date | 25-Jun-2016 |