WERAM Information
Tag | Content | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
WERAM ID | WERAM-Mum-0027 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein ID | ENSMUSP00000018716.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Uniprot Accession | Q8BSN5; PHF23_MOUSE; Q3TCH1; Q8BT31; Q8CDY2; Q8CIA4; Q8CIU8; Q8CIU9; Q9CWC8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Protein ID | NP_001278054.1; NP_001278055.1; NP_001278056.1; NP_084340.2; XP_006534565.2; XP_006537281.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | PHD finger protein 23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Nucleotide ID | NM_001291125.1; NM_001291126.1; NM_001291127.1; NM_030064.4; XM_006534502.2; XM_006537218.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | PHF23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Details |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Reviewed | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Classification |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NCBI Taxa ID | 10090 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Functional Description (View) |
Acts as a negative regulator of autophagy, through promoting ubiquitination and degradation of LRSAM1, an E3 ubiquitin ligase that promotes autophagy in response to starvation or infecting bacteria. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Domain Profile | Me_Reader PHD PHD.txt 3 iClvCgkddegekemvqCdeCddwfHlkCvklplsslpegkswyCpsCke 52 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Sequence (Fasta) | MLEAMAEPSP EDPPPTLKPE TQPPEKRRRT IEDFNKFCSF VLAYAGYIPP SKEESDWPAS 60 GSSSPLRGES AADSDGWDSA PSDLRTIQTF VKKAKSSKRR AVQSGPTQPG PPRSTFSRLQ 120 APDSATLLEK MKLKDSLFDL DGPKVASPLS PTSLTHTSRP PAALAPVPLS QGDLSQPRKK 180 DRKNRKLGPG GGAGFGVLRR PRPAPGDGEK RSRIKKSKKR KLKKADRGDR LPPPGPPRAP 240 PSDTDSEEEE EEEEEEDDEE EMTVGGGVPA PVLPTPPEAP RPPVTVHSEG APPTDSEGKD 300 VGSTETSQDG DASSSEGEMR VMDEDIMVES GDDSWDLITC YCRKPFAGRP MIECSLCGTW 360 IHLSCAKIKK TNVPDFFYCQ KCKELRPEAR RLGGLPKSGE P 401 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Nucleotide Sequence (Fasta) | GAGGGAGGAG AGAGGAGGAG GAGGAGGAGG GAGCAGGCGG CCGGCGGTGC GGGGGGAGGG 60 GGCCCGGTCC GGGAGTGCGG GAGGCAGTGG TGGAGGGAGG TGGCGGTAGC GGAGTGGAGT 120 CTCAACCGCG CCAAGCGGAC ACTTCGGTGG AGCGAGGCGG TAGAAACACG GAGCACTCAA 180 GGCAGCACCG GGAATCCCGG CTTCGAGGAG GGGGTCGCCG GACCGGGTGG AGGGGAGGGG 240 GCGATGCTGG AAGCCATGGC GGAGCCCAGT CCCGAAGATC CGCCTCCGAC TCTTAAACCA 300 GAGACTCAGC CACCGGAGAA AAGGCGGAGA ACCATTGAGG ATTTTAACAA ATTCTGCAGT 360 TTTGTCTTGG CCTATGCTGG TTACATCCCC CCTAGCAAAG AGGAAAGCGA TTGGCCAGCC 420 TCTGGCTCTA GCTCTCCATT GCGAGGTGAG AGTGCAGCAG ACAGTGATGG CTGGGACTCG 480 GCCCCGTCGG ACCTTCGAAC TATCCAGACT TTTGTTAAGA AAGCAAAGTC ATCAAAGAGA 540 AGGGCAGTTC AATCAGGTCC TACCCAGCCA GGACCCCCAA GGTCCACTTT TTCTCGTCTG 600 CAGGCTCCTG ACAGTGCTAC TCTGCTTGAG AAGATGAAGC TCAAGGACTC TCTTTTTGAT 660 CTGGATGGGC CCAAAGTGGC ATCTCCACTC TCTCCCACAT CATTGACGCA TACTTCCCGG 720 CCCCCCGCTG CTCTCGCCCC AGTGCCGCTG TCCCAGGGGG ACCTCTCCCA GCCTCGAAAG 780 AAGGACCGAA AGAATAGAAA GTTGGGACCA GGAGGTGGGG CTGGCTTTGG GGTGCTTCGG 840 AGACCTCGAC CAGCTCCTGG GGATGGGGAA AAGCGGTCTC GAATCAAGAA GAGCAAGAAG 900 CGGAAGTTGA AAAAGGCAGA TCGGGGAGAT AGACTCCCAC CTCCTGGCCC TCCTAGGGCT 960 CCTCCCAGTG ATACAGACTC TGAAGAGGAG GAGGAAGAGG AAGAAGAGGA AGATGATGAG 1020 GAAGAGATGA CAGTGGGGGG TGGAGTCCCA GCCCCTGTGC TCCCAACACC CCCTGAGGCC 1080 CCCAGGCCCC CTGTTACAGT GCACTCTGAA GGTGCTCCCC CTACTGACAG TGAAGGCAAA 1140 GATGTGGGCA GCACAGAAAC AAGCCAAGAT GGAGATGCTA GCTCCAGTGA AGGCGAGATG 1200 CGGGTCATGG ATGAGGACAT CATGGTAGAA TCAGGTGACG ACTCCTGGGA TCTGATCACG 1260 TGTTACTGCA GAAAGCCCTT TGCGGGGCGG CCCATGATTG AGTGCAGCCT CTGTGGGACG 1320 TGGATCCACC TCTCCTGTGC TAAGATTAAG AAGACCAACG TTCCCGACTT CTTTTATTGC 1380 CAGAAATGCA AGGAACTTCG GCCAGAGGCC CGGCGGTTAG GGGGTCTCCC CAAATCTGGA 1440 GAACCCTGAC ATCACTAAGG CTGGAACTTG TGACATTACT TGGGAACTGA GCCTCAGGGT 1500 CCCCAGCCTT CCCTTGGAGT GAGGAGGCTG TCCCCACTTG AGGGCCACAA TTCCCAAGGG 1560 AGACGTATTT GGAAATGAGT GTCTTCTACT CTGTCCTTCC TGCTCCATGG ACTTGAAGTT 1620 GACCCCATTA CAGTTGGGTC GGGGAGGCTG GATCTGTAGA CAGAATCTCT GTCCAGTCAA 1680 CCCTGTACCC TTTTCACTTG CAGGTCCAGG GCTCAAACTG GGATGTAATG GGATAGTTGT 1740 CTATAAAACT GTAGTGTAAA TACAGCACTC CCCTCATGTT TCTTCTCTCT CCCGTTTACT 1800 TTCTTTTACA CCGGATGTAT TTTTAATTTG GGGCTCCCCC ATTTGAGCGA GGTTGCTCAG 1860 AGGTGGAGTA CCAAAGCCTG TGGAGTGAGG AAGGAAAGAA AAAGGTGTCA ATTAGCACTC 1920 GCCTCGTTTT TAATACTGTT GGCCGGCTGC TCAGACAGAC GGCCTGCGTG TTGTAAATAA 1980 AGCAGAGTGG GCTCTTGTGT TTTACA 2007 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence Source | Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Keyword | KW-0007--Acetylation |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interpro | IPR011011--Znf_FYVE_PHD |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PROSITE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pfam | PF00628--PHD |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | GO:0005737--C:cytoplasm |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthology |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Created Date | 25-Jun-2016 |