WERAM Information

Tag Content
WERAM ID WERAM-Cii-0044
Ensembl Protein ID ENSCINP00000016421.3
Gene Name
Ensembl Information
Ensembl Gene ID Ensembl Transcript ID Ensembl Protein ID
ENSCING00000008026.3 ENSCINT00000016421.3 ENSCINP00000016421.3
Status Unreviewed
Classification
Type Family E-value Score Start End
Ac_Reader Bromodomain 2.00e-05 24.3 38 240
Organism Ciona intestinalis
Domain Profile
  Ac_Reader Bromodomain
             BROMO.txt 16 qleipdYydiikePmdLstiker 38
                             ++d ++ +  ++ L+t++++
  ENSCINP00000016421.3 38 VEHATDWQTTFLAHVCLDTVEQT 60
                          33456666666677777777766 PP
             BROMO.txt  14 dpqleipdYydiikePmdLstikerlee 41 
                           +    ++dY++ +  ++ L+t+++++e+
  ENSCINP00000016421.3 108 KMVEHATDYQTTFLAHVCLDTVEQTVEQ 135
                           4446799******************996 PP
             BROMO.txt  17 leipdYydiikePmdLstikerl 39 
                             ++dY++ +  ++ L+t+++++
  ENSCINP00000016421.3 147 EHATDYQTTFLAHVGLDTVEQTV 169
                           5789****************987 PP
             BROMO.txt  13 vdpqleipdYydiikePmdLstiker 38 
                           v+    ++dY+ i   ++ L+t+ ++
  ENSCINP00000016421.3 215 VKMVEHATDYQRISLAHVCLDTVAQT 240
                           55546799*****9999******987 PP
Protein Sequence
(Fasta)		MVEHAAEEQQ PILAHVRLDT VEQTVKQIYV LLELVKMVEH ATDWQTTFLA HVCLDTVEQT 60
VRLIGASHHL VKIVEHATEL QIVTLAHVCL DLVEETVKQI YVLLELVKMV EHATDYQTTF 120
LAHVCLDTVE QTVEQIYVLL ELVKMVEHAT DYQTTFLAHV GLDTVEQTVR LIAAHLIHVL 180
TMGIVVELWV DINVIVNQVT LEEDVFKIYV LLELVKMVEH ATDYQRISLA HVCLDTVAQT 240
V 241
Nucleotide Sequence
(Fasta)		AAATGGTGGA ACATGCAGCA GAGGAACAAC AACCTATTCT TGCTCATGTG CGTCTGGATA 60
CAGTGGAACA AACTGTGAAA CAGATTTATG TGCTACTGGA ACTTGTCAAA ATGGTGGAAC 120
ATGCAACAGA TTGGCAAACG ACTTTTCTTG CTCATGTATG CCTGGATACA GTGGAACAAA 180
CTGTCAGATT GATTGGTGCA TCTCATCACC TTGTCAAAAT AGTGGAACAT GCAACAGAAT 240
TACAAATAGT TACACTTGCT CATGTATGCC TGGATTTAGT GGAGGAAACT GTGAAACAGA 300
TTTATGTGTT GCTGGAACTT GTAAAAATGG TGGAACATGC AACAGATTAC CAAACGACTT 360
TTCTTGCTCA TGTATGCCTG GATACAGTGG AACAAACTGT GGAACAGATT TATGTTCTGC 420
TGGAACTTGT CAAAATGGTG GAACATGCAA CAGATTACCA AACGACTTTT CTTGCTCATG 480
TAGGCCTGGA TACAGTGGAA CAAACTGTCA GATTGATAGC TGCTCACCTG ATCCATGTGC 540
TAACAATGGG AATTGTAGTC GAATTGTGGG TGGATATAAA TGTCATTGTC AACCAGGTTA 600
CATTGGAAGA AGATGTCTTC AAGATTTATG TGTTGCTGGA ACTTGTCAAA ATGGTGGAAC 660
ATGCAACAGA TTACCAAAGA ATTTCACTTG CTCATGTATG CCTGGATACA GTGGCACAAA 720
CTGTCA 727
Sequence Source Ensembl
Orthology
Created Date 25-Jun-2016